Rna-Polymerastyper och roller i eukaryoter

RNA-polymeras (RNAP) är enzymet som ansvarar för transkription i eukaryota celler. Till skillnad från bakterieceller där en enda RNAP underlättar transkription finns det tre typer av RNAP i eukaryoter som spelar olika roller i genuttryck.

bildkredit: Ktsdesign /

RNA polymeras struktur

subenheter

alla tre RNAPs har katalytiska kärnor bestående av 10 subenheter., Fem av dessa är kärnunderenheter som bildar krabba klo former med DNA i sina centrum, kanaler för RNA-produkter och NTP-substrat samt ytterligare 5 enheter.

kloliknande form stabiliserar DNA och möjliggör korrekt bildning av transkriptionsbubblor (regioner där DNA-strängar har avlindas nära gener som ska transkriberas.) RNAP II består endast av 12 underenheter totalt. Tillsammans med de 10 katalytiska subenheterna som finns i alla rnap, har RNAP II två Rpb4 trip 7 som initiering transkription.,

RNAP II är enzymet som primärt är ansvarigt för syntesen av messenger RNA (mRNA). Rnap i och III innehåller en extra heterodimer subenhet. Rnap III ensam har en heterotrimer subenhet, vilket ger totalt 17 subenheter.

Upprepningssekvenser

RNAP II har flera upprepningsenheter placerade vid karboxyländen (Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser) som inte finns i antingen RNAP i eller III. dessa upprepningar tillåter proteiner att binda till rnap II-molekylen och initiera dess aktivitet.,

funktionell betydelse av subenheter

de ytterligare subenheter som finns i RNAP III tros ge enzymet ökad flexibilitet jämfört med andra rnap. Medan RNAP I (belägen i kärnan) är ensam ansvarig för syntesen av den stora ribosomala RNA (rRNA) – subenheten.

den mycket rikliga RNAP III, känd för sin stabilitet, syntetiserar stora mängder tRNA, 5S rRNA och andra produkter för proteinsyntes. Både polymeraser, spelar strukturella och katalytiska roller inom cellen.,

rnap II: s roll vid transkription

bindning till promotor

oavsett art spelar RNAP en roll vid transkription. Genom att binda till promotorplatsen på en DNA-sträng bildar RNAP tillsammans med transkriptionsfaktorer ett transkriptionsförinitieringskomplex (PIC). Detta initierar transkriptionsprocessen.

promotorn webbplatsen är en region som ligger uppströms vid 5′ slutet av en DNA-sträng. En AT-rich Tata box är den mest erkända promotorsekvensen och används av RNAP II. denna promotor finns dock endast hos cirka 10-15% av däggdjursarterna.,

transkriptionsfaktorer som TFIID binder till Tata-rutan och orsakar en dramatisk förändring i formen på DNA-stativet. Detta gör det möjligt för andra proteiner att montera på promotorplatsen med RNAP II, som bildar transkriptionsinitiationskomplexet (TIC).

tillsats av fosfatgrupper

fosfatgrupper tillsätts till svansen slutet av RNAP II av TFIIH, frigöra enzymet så att det kan starta processen för transkription. Transkriptionsfaktorerna på promotorplatsen släpps sedan och återvinns, så att de kan börja en ny transkriptionsrunda., Fosfatas avlägsnar fosfatgrupperna från RNAP II när transkriptionsprocessen är klar.

5′ Cap

RNA är begränsat till 5′ end. Denna keps består av guanin och en metylgrupp. Rna-polyadenylering sker vid 3-änden, där adenosinmonofosfatreperationerna tillsätts till RNA-molekylen vilket resulterar i bildandet av en poly a-svans. Detta hjälper en smidig överföring av mRNA från kärnan, ökar dess livslängd i cellcytoplasma och förbättrar dess translationella effektivitet.,

transkription underlättad av RNA-polymeras i och III

promotorsekvensen associerad med syntesen av rRNA är 150 baspar i längd. Två transkriptionsfaktorer, UBF och SL1 binder till promotorn och rekryterar RNAP I till webbplatsen.

de promotorsekvenser som används av RNAP III skiljer sig från dem som används av andra polymeraser eftersom de är interna promotorer snarare än i en uppströms plats. Transkriptionsfaktorn TFIIIC binder till promotorn som ligger inom DNA-strängen och rekryterar TFIIIB uppströms transkriptionsstarten.,

de efterföljande händelserna är inte väl karaktäriserade, även om det har föreslagits att RNAP III dissocierar långsamt från dess transkriptionsfaktorer vilket resulterar i en långsam clearance från initieringsstället.

Ytterligare läsning

• allt rna-innehåll
• Vad är RNA?
• rna struktur
• typer av RNA: mRNA, rRNA och tRNA
• RNA syntes

citat