inbördeskrig och triumvirat
i 49, året inbördeskriget bröt ut mellan Pompey och Caesar, Antony var tribune av plebs och kraftfullt stödde Caesar. Han flydde från Rom till Caesars högkvarter efter att ha fått hot om våld. Antony kämpade i den korta italienska kampanjen som tvingade Pompey att evakuera den italienska halvön. Efter denna Caesar lämnade honom ansvarig för Italien under den spanska kampanjen., Han anslöt sig sedan till Caesar i Grekland, befallde sin vänstra flygel i slaget vid Pharsalus, och skickades tillbaka som mästare på hästen (en diktators andra kommando) i 48 för att hålla ordning i Italien. Han misslyckades med att göra detta och var förmodligen bort från sin tjänst i 47; han var utan anställning fram till 44, när han blev konsul som kollega och senare präst (flamen) av Caesar., Som konsul och lupercus, en av firandet av lupercalias festival (en fertilitetsfestival tidigt på året), erbjöd han Caesar en diadem—ett band som betecknar royalty—som Caesar, pressad av medborgarnas öppna distaste för monarki, vägrade att acceptera.
Efter Caesars mord fick Antony besittning av statskassan och av Caesars papper, som han använde (och kanske kompletterade) till sin egen fördel., Under en tid följde han en måttlig politik, men när han utmanades av den 19-årige Octavianus (senare kejsaren Augustus), Caesars adopterade son och arvinge, vände han sig mot Caesars mördare. I juni 44 gav senaten honom norra och centrala Gallien och norra Italien som sin provins i fem år. Cicero angrep honom dock våldsamt i filipperna mellan september 44 och april 43, och Octavianus gick samman med konsulerna i 43. Deras kombinerade styrkor besegrade två gånger Antony, som belägrade Brutus Albinus vid Mutina (nuvarande Modena)., Antony lyckades dra sig tillbaka till södra Gallien. De motsatta arméerna bröt upp efter båda konsulernas död, och Antony förenades av Marcus Aemilius Lepidus och Lucius Munatius Plancus med sina arméer. I början av November mötte Octavian—vid denna tidpunkt de konsulära arméerna—Antony och Lepidus i Bononia (nuvarande Bologna). De tre ingick en femårig pakt, som snart ratificerades av en lag, och gav dem en gemensam autokrati, triumviratet., Mer än 200 män var förbjudna och (när de fångades) dödade (Cicero var en av dem), antingen för att de var fiender till triumvirerna eller för att konfiskera sin rikedom. I 42 Gaius Cassius och Marcus Brutus, besegrade i två strider i Philippi (Makedonien) där Antony utmärkte sig som befälhavare, dödade sig och, med dessa handlingar, den republikanska orsaken.
triumvirerna hade gått med på att dela riket, så Antony fortsatte att ta upp administrationen av de östra provinserna. Han kallade först Cleopatra, Egyptens drottning, till Tarsus (sydöstra Asien Minor) för att svara på rapporter om att hon hade hjälpt sina fiender. Hon befriade sig framgångsrikt, och Antony tillbringade vintern 41-40 som sin älskare i Alexandria, Egypten., Trots de gamla författarnas romantiska redogörelser gjorde han dock inget drag för att se henne igen i mer än tre år, även om han kraftigt ökade sina territoriella ägodelar under det intervallet.
tidigt i 40 Antonys bror, konsuln Lucius Antonius, med stöd av Antonys fru Fulvia, uppror mot Octavianus i Italien. Octavian besegrade upproret, fånga och förstöra Perusia (dagens Perugia). Antony var tvungen att återvända till Italien och lämnade sin general Ventidius för att hantera en Parthiansk invasion av Mindre Asien och Syrien., Efter första skärmytslingar försonades Antonius och Octavianus vid Brundisium (nuvarande Brindisi) och sedan Fulvia hade dött under tiden gifte sig Antonius med Octavianus syster Octavia. De två männen delade riket mellan dem, Octavian tar allt väster om Scodra (dagens Shkodër, Alb.) och Antony everything east. Lepidus, som tidigare hade varit begränsad till Afrika, fick behålla det. År 39 ingick Antony och Octavian ett avtal med Sextus Pompeius (se Pompeius Magnus Pius, Sextus), som kontrollerade haven och hade blockerat Italien.,
Antony och Octavia gick till Aten, där de var deified; Antony förklarades den nya Dionysus, mystic gud vin, lycka och odödlighet. Antony organiserade sedan öst. Ventidius knuffade under tiden Parthiansna ut ur Asien Minor i 40 och körde dem tillbaka bortom Eufratfloden (39-38). Herodes—son till en framstående palestinsk Judisk vän till Rom, Antipater-bildades i Jerusalem som kung av Judaea i 37. När Octavianus hade problem i Italien och Väst i 37, mötte Antony honom i Tarentum, levererade honom med fartyg och gick med på att förnya triumviratet i ytterligare fem år., Lepidus var kanske inte med. I 36 Octavianus allmänt Marcus Vipsanius Agrippa besegrade Sextus Pompejus. Sedan annekterade Lepidus och Octavian Afrika. Octavia, efter att ha varit i Rom sedan 37, skickades till Antony av Octavian i 35. Antony skickade tillbaka henne eftersom hon kom med nästan ingen av trupperna Antony hade lånat Octavianus. En långberedd attack på Parthia i 36 misslyckades, med stora förluster—Det var Antonys första militära misslyckande. Vid denna tidpunkt vände han sig igen till Cleopatra, som hade burit honom två barn och gett honom fullt politiskt och ekonomiskt stöd.