RNA-Polymerasetypen en-rollen in eukaryoten

RNA-polymerase (RNAP) is het enzym dat verantwoordelijk is voor transcriptie in eukaryotische cellen. In tegenstelling tot bacteriële cellen waar één enkele rnap transcriptie vergemakkelijkt, zijn er drie types van RNAP in eukaryotes die verschillende rollen in genuitdrukking spelen.

beeld: KTSDESIGN /

RNA-Polymerasestructuur

subeenheden

alle drie Rnap ‘ s hebben katalytische kernen bestaande uit 10 subeenheden., Vijf hiervan zijn kernsubeenheden die krabklauwvormen vormen met DNA in hun centra, kanalen voor RNA-producten en NTP-substraten evenals een extra 5 eenheden.

De klauwachtige vorm stabiliseert het DNA en zorgt voor de juiste vorming van transcriptiebellen (gebieden waar DNA-strengen zijn afgewikkeld in de buurt van genen die moeten worden getranscribeerd.) RNAP II wordt slechts samengesteld uit 12 subeenheden in totaal. Samen met de 10 katalytische subeenheden die in alle rnaps worden gevonden, heeft RNAP II twee Rpb4 ⁄ 7 die initiatietranscriptie.,

RNAP II is het enzym dat primair verantwoordelijk is voor de synthese van messenger-RNA (mRNA). RNAP I en III bevatten een extra heterodimere subeenheid. Rnap III alleen heeft een heterotrimere subeenheid, die een totaal van 17 subeenheden geven.

Herhaalsequenties

RNAP II heeft verschillende herhaaleenheden aan het carboxyluiteinde (Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-ser) die niet worden gevonden in RNAP I of III. deze herhalingen maken het mogelijk dat eiwitten zich binden aan het rnap II-molecuul en de activiteit ervan initiëren.,

functionele significantie van subeenheden

de extra subeenheden die in RNAP III worden gevonden, zouden het enzym meer flexibiliteit geven in vergelijking met andere Rnap ‘ s. Terwijl RNAP I (gelegen in de kern) alleen verantwoordelijk is voor de synthese van de grote ribosomale RNA (rRNA) subeenheid.

de zeer overvloedige RNAP III, bekend om zijn stabiliteit, synthetiseert grote hoeveelheden tRNA, 5S rRNA en andere producten voor eiwitsynthese. Beide polymerasen, spelen structurele en katalytische rollen binnen de cel.,

rol van RNAP II in transcriptie

Binding aan promotor

ongeacht de soort speelt RNAP een rol in transcriptie. Door aan de promotorplaats op een bundel van DNA te binden, vormen RNAP samen met transcriptiefactoren een complexe transcriptie pre-initiatie (PIC). Dit initieert het proces van transcriptie.

De promotorlocatie is een gebied stroomopwaarts gelegen aan het 5 ‘ uiteinde van een DNA-streng. Een At-rijke Tata-doos is de meest erkende promotoropeenvolging en wordt gebruikt door RNAP II. nochtans, wordt deze promotor slechts gevonden in ongeveer 10-15% van zoogdierspecies.,

transcriptiefactoren zoals TFIID binden zich aan de Tata box en veroorzaken een dramatische verandering in de vorm van de DNA standaard. Dit staat andere proteã nen toe om bij de promotorplaats met RNAP II te assembleren, die de complexe transcriptieinitiatie (Tic) vormen.

toevoeging van fosfaatgroepen

fosfaatgroepen worden toegevoegd aan het uiteinde van RNAP II door TFIIH, waardoor het enzym vrijkomt zodat het transcriptieproces kan starten. De transcriptiefactoren bij de promotorplaats worden dan vrijgegeven en gerecycleerd, die hen toelaten om een nieuwe ronde van transcriptie te beginnen., Phosphatase verwijdert de fosfaatgroepen van RNAP II zodra het proces van transcriptie wordt voltooid.

5′ Cap

het RNA is afgetopt aan het einde van 5′. Deze dop bestaat uit guanine en een methylgroep. De POLYADENYLATIE van RNA komt bij 3′ eind voor, waar de herhalingen van adenosine monofosfaat aan de molecule van RNA worden toegevoegd resulterend in de vorming van een poly een staart. Dit helpt de vlotte overdracht van mRNA van de kern, verhoogt het levensduur in celcytoplasma, en verbetert zijn Vertalende efficiency.,

transcriptie gefaciliteerd door RNA-Polymerase I en III

De promotorsequentie geassocieerd met de synthese van rRNA is 150 basenparen in lengte. Twee transcriptiefactoren, UBF en SL1 binden aan de promotor en werven RNAP I aan de plaats.

De promotorsequenties die door RNAP III worden gebruikt, verschillen van die welke door andere polymerasen worden gebruikt, aangezien zij interne promotors zijn in plaats van in een stroomopwaartse locatie. De transcriptiefactor tfiiic bindt aan de promotor die binnen de bundel van DNA wordt gevestigd en werft tfiiib vóór de plaats van het transcriptiebegin aan.,

de volgende gebeurtenissen zijn niet goed gekarakteriseerd, hoewel er gesuggereerd werd dat RNAP III zich langzaam distantieert van de transcriptiefactoren, wat resulteert in een langzame klaring van de initiatieplaats.

verdere lezing

• alle RNA-inhoud
• Wat is RNA?
• RNA-structuur
• typen RNA: mRNA, rRNA en tRNA
• RNA-synthese