Termodynamikk av Hydrofobe Interaksjoner
Når en hydrophobe er falt i et vandig medium, hydrogen bindingene mellom vannmolekylene vil være brutt for å gjøre plass for de hydrophobe; imidlertid, vann molekyler reagerer ikke med hydrophobe. Dette er ansett som en endothermic reaksjon, fordi når obligasjonene er brutt varme er satt i system., Vannmolekyler som er forvrengt ved tilstedeværelse av hydrophobe vil gjøre nye hydrogen obligasjoner og danne en is-som bur strukturen kalles en clathrate bur rundt hydrophobe. Denne orienteringen gjør systemet (hydrophobe) mer strukturert med en reduksjon av den totale entropien til systemet, og derfor er \( \Delta S < 0\).,
endre i entalpi (\( \Delta T \)) av systemet kan være negativ, null eller positiv fordi den nye hydrogen obligasjoner kan delvis og helt, eller over kompensere for hydrogen obligasjoner brutt ved inngangen til hydrophobe. Endringen i entalpi, men er ubetydelig i å bestemme spontanitet av reaksjonen (blanding av hydrofobe molekyler og vann) fordi endringen i entropi (\( \Delta S \)), er stort.
Ifølge Gibbs Energi formel
\