I pazienti con PS2 presentano un cranio a quadrifoglio (deformità cranica trilobata) che può causare una crescita cerebrale limitata e una disfunzione neurologica associata, nonché un significativo compromesso delle vie respiratorie superiori. La seconda caratteristica principale è ampio medialmente deviato pollici e alluce e brachidattilia variabile e sindattilia, così come anchilosi del gomito o del ginocchio. Le manifestazioni neurologiche come l’idrocefalo e le convulsioni sono una delle principali fonti di morbilità. Ritardi di sviluppo e intellettuali sono comuni., La proptosi estrema associata alla deformità del quadrifoglio causa la cheratopatia da esposizione. Ulteriori segni oculari includono atrofia ottica, ptosi, strabismo, coloboma dell’iride, errori di rifrazione, cataratta e ambliopia. Possono essere presenti anche anomalie del tratto respiratorio come palatoschisi, stenosi coanale o atresia e malformazioni laringotracheali. L’ostruzione delle vie aeree risultante e l’apnea ostruttiva del sonno sono una fonte significativa di morbilità., Sono stati riportati anche pazienti con ernia cerebrale o cerebellare, malrotazione intestinale, malposizione dell’ano, idronefrosi, scroto bifido e cistifellea ipoplastica. Data la gravità delle manifestazioni della malattia e le complicanze associate, la prognosi di questo tipo di PS è scarsa, con un alto rischio di morte precoce, sebbene il potenziale di sopravvivenza a lungo termine possa essere aumentato da un trattamento precoce aggressivo. Le cause di morte sono principalmente complicazioni respiratorie e neurologiche.