Il primo figlio di Maria Teresa, una figlia di nome Maria Elisabeth (1737-1740), morì mentre era ancora un bambino. La maggiore dei figli sopravvissuti fu Maria Anna (1738-1789), che sviluppò forti interessi intellettuali ed era molto simile nel carattere a suo padre. Afflitta da una deformazione della cassa toracica, non fu considerata da marito e rimase con la madre fino alla morte di quest’ultima nel 1780. Successivamente Maria Anna trascorse i suoi restanti anni come badessa del convento di Santa Elisabetta a Klagenfurt, a cui lasciò la sua considerevole proprietà.,
La terza figlia, Maria Karolina (nata nel 1740), morì nell’infanzia.
L’arrivo di Giuseppe (1741-1790) pose fine alla lunga attesa di un erede maschio. Come imperatore e successore di Maria Teresa e sovrano della Monarchia asburgica ha la sua biografia su questo sito.
Maria Cristina (1742-1798) era la figlia preferita di Maria Teresa, ma non era particolarmente popolare tra i suoi fratelli. Era l’unica figlia autorizzata a sposarsi per amore piuttosto che per considerazioni politiche., Suo marito era il duca Alberto di Sassonia-Teschen (1738-1822), un membro non dominante della dinastia Wettin sassone ampiamente ramificata, la cui madre era l’arciduchessa Maria Giuseppa, cugina di Maria Teresa, e che era quindi abbastanza strettamente imparentata con la sua sposa.
Secondo i resoconti contemporanei, Maria Elisabeth (1743-1808) era molto carina e quindi scelse di svolgere un ruolo di primo piano nei piani matrimoniali di sua madre. Tuttavia, il suo aspetto fu distrutto da un attacco di vaiolo e rimase nubile, diventando in seguito piuttosto eccentrica e irascibile.,
Il secondogenito Karl Joseph (1745-1761) era il figlio prediletto di Maria Teresa: intelligente e affascinante, era più simpatico del principe ereditario Giuseppe, piuttosto ritirato, con il quale il suo rapporto era di fraterna rivalità. La sua morte prematura all’età di soli sedici anni, quando un’epidemia di vaiolo portò via diversi membri della famiglia, fu un colpo particolarmente pesante per i suoi genitori.
Maria Amalie (1746-1804) sposò il duca Ferdinando di Parma contro la sua espressa volontà nell’ambito del riavvicinamento con i Borboni., Determinato e forte, non ha mai perdonato la madre e il loro rapporto è rimasto fresco per il resto dei loro giorni.
Il terzo figlio Pietro Leopoldo (1747-1792) inizialmente aveva poche possibilità di ereditare il trono. Dopo la morte prematura di suo fratello Karl divenne il prossimo in linea per succedere a suo padre come Granduca di Toscana. Quando suo fratello maggiore Giuseppe II morì senza problemi, divenne il suo successore sul trono imperiale, carica che mantenne solo per due anni.,
Fu seguito da due ragazze, che morirono entrambe giovani: Maria Karoline, nata nel 1748, morì poco dopo la nascita, mentre Johanna, nata nel 1750, morì di vaiolo all’età di dodici anni.
Un’altra vittima del vaiolo fu Maria Giuseppa (1751-1767), che morì poco prima di sposare il principe ereditario napoletano.
Il suo posto fu preso dalla successiva figlia maggiore, Maria Karolina (1752-1814), che come controversa regina di Napoli e Sicilia si sarebbe rivelata una vera figlia di Maria Teresa. Era ancora più prolifica di sua madre, dando alla luce un totale di diciotto figli.,
Ferdinand Karl Anton (1754-1806) era un personaggio piuttosto anonimo. Sposò l’ereditiera della dinastia d’Este, che governava il principato settentrionale italiano di Modena, e fondò la linea collaterale Asburgo-Modena.
La figlia più nota di Maria Teresa fu Maria Antonia (1755-1793), che come Maria Antonietta sarebbe diventata regina di Francia e alla fine avrebbe incontrato la sua fine sotto la lama della ghigliottina.
Maximilian Franz (1756-1801), la più giovane prole di Maria Teresa, era un bambino malato e quindi destinato a una carriera nella Chiesa., Divenne arcivescovo ed elettore di Colonia e fu nominato Gran Maestro dei Cavalieri Teutonici.