Filogenesi, storia dell’evoluzione di una specie o di un gruppo, specialmente in riferimento alle linee di discendenza e alle relazioni tra ampi gruppi di organismi.
Fondamentale per la filogenesi è la proposizione, universalmente accettata nella comunità scientifica, che piante o animali di specie diverse discendono da antenati comuni. La prova di tali relazioni, però, è quasi sempre incompleta, per la stragrande maggioranza delle specie che hanno mai vissuto sono estinte, e relativamente pochi dei loro resti sono stati conservati nei reperti fossili. La maggior parte delle filogenie sono quindi ipotesi e si basano su prove indirette. Diverse filogenie spesso emergono utilizzando le stesse prove., Tuttavia, c’è un accordo universale sul fatto che l’albero della vita è il risultato di una discendenza organica da antenati precedenti e che le vere filogenie sono rilevabili, almeno in linea di principio.