Tre termini tecnici comuni nella genetica molecolare, esone, introne e codone, hanno definizioni tecniche specifiche, ma sono spesso usati in presentazioni affrettate o brevi. La cosa principale da ricordare è che l’esone e gli introni sono caratteristiche del DNA, mentre i codoni sono caratteristiche dell’RNA. Le sequenze omologhe nell’altro tipo di nucleico devono essere chiamate qualcos’altro, altrimenti c’è il pericolo che i ruoli del DNA e dell’RNA nel Dogma centrale (“Il DNA rende l’RNA rende la proteina”) saranno confusi.,
Per definizione, gli esoni e gli introni sono sequenze in una regione di geni codificanti proteine di una molecola di DNA a doppio filamento (dsDNA) che sono espressi come proteine o sequenze interventistiche non così espresse. Gli esoni e gli introni sono tipicamente mostrati come le sequenze a filamento singolo del filamento di senso del dsDNA, scritte 5 ‘-3’, da sinistra a destra.
Trascrizione del filamento modello complementare produce un RNA nucleare eterogeneo (hnRNA) che è identico (co-lineare) in 5′-3′ orientamento e sequenze di base al filamento senso del DNA, con la sostituzione di U per T., Le sequenze di RNA equivalenti agli esoni e agli introni del DNA sono a volte indicate come “esoni” e “introni”, tuttavia questo è tecnicamente errato e confonde anche il loro ruolo funzionale nella trascrizione e nella traduzione con esoni e introni come sequenze geniche nel DNA. Le sequenze di RNA equivalenti agli esoni e agli introni del DNA possono essere denominate rispettivamente “trascritti di esoni” e “trascritti di introni” o “equivalenti”.
L’elaborazione dell’hnRNA in mRNA comporta l’escissione (“splicing out”) delle trascrizioni introniche e la legatura degli esoni rimanenti., Una volta formato l’mRNA finale, la traduzione è il processo di lettura (come amminoacidi) di una serie di sequenze a tre basi chiamate codoni. I codoni vengono letti secondo il Codice genetico, che è un codice RNA. Poiché la regione dell’mRNA è equivalente all’esone del DNA, la stessa serie può essere identificata nel filamento di senso (sostituendo T per U). I motivi del DNA a tre basi sono alcuni chiamati “codoni”, tuttavia questo è di nuovo tecnicamente errato e confonde il contenuto informativo dei geni con la funzione dell’RNA nel Codice genetico. Gli equivalenti del DNA ai codoni possono essere indicati come ‘ triplette.,’
In bioinformatica, le 64 terzine sono talvolta presentate come una “tabella di traduzione” che può essere utilizzata direttamente con la sequenza del filamento di DNA Sense per dedurre la sequenza proteica. Questo è pratico, tranne che “traduzione” qui significa “estrazione di informazioni codificate” non è la stessa del processo molecolare della traduzione di mRNA.
C’è un’app per questo: vedi SM Carr, HT Wareham & Craig D. 2014. Un’applicazione web per la generazione di esempi di sequenza di DNA con frame di lettura aperti e chiusi in genetica e bioinformatica educazione., CBE-Life Sciences Education 13, 373-374, che esamina questo e include un’app che rende dsDNA come sequenze proteiche.