RNA Polymeráza Typy a Role v Eukaryot

RNA polymeráza (RNAP) je enzym odpovědný za transkripce v eukaryotické buňky. Na rozdíl od bakteriálních buněk, kde jeden RNAP usnadňuje přepis, tam jsou tři typy RNAP u eukaryot, které hrají různé role v genové expresi.

Image Credit: Ktsdesign /

RNA polymerázová struktura

podjednotky

všechny tři Rnap mají katalytická jádra sestávající z 10 podjednotek., Pět z nich jsou základní podjednotky, které tvoří Krabí dráp tvary s DNA ve svých centrech, kanály pro RNA produktů a NTP substrátů, stejně jako dalších 5 jednotek.

dráp jako tvar stabilizuje DNA a umožňuje správnou tvorbu transkripční bubliny (regionech, kde DNA vlákna se odvíjí v blízkosti genů, které mají být přepsány.) RNAP II se skládá pouze z 12 podjednotek celkem. Spolu s 10 katalytické podjednotky nalézt ve všech RNAPs, RNAP II má dvě Rpb4⧸7, které zahájení transkripce.,

RNAP II je enzym primárně zodpovědný za syntézu messenger RNA (mRNA). RNAP I a III obsahují další heterodimerní podjednotku. Samotný rnap III má heterotrimerní podjednotku, která poskytuje celkem 17 podjednotek.

Opakovat sekvence

RNAP II má několik opakování jednotky nacházející se v jeho karboxylovému konci (Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser), které nejsou nalezeny v obou RNAP I nebo III. Tyto opakuje umožňují proteiny vázat na RNAP II molekuly a zahájit jeho činnost.,

Funkční významnosti podjednotek

další podjednotky nalézt v RNAP III jsou myšlenka dát enzymu zvýšenou flexibilitu ve srovnání s jinými RNAPs. Zatímco RNAP I (umístěný v jádru) je výhradně zodpovědný za syntézu velké podjednotky ribozomální RNA (rRNA).

vysoce hojný RNAP III, známý svou stabilitou, syntetizuje velké množství tRNA, 5S rRNA a dalších produktů pro syntézu bílkovin. Obě polymerázy hrají strukturální a katalytické role v buňce.,

Role RNAP II během transkripce

Vazba na promotor

bez Ohledu na druh, RNAP hraje roli v transkripci. Vazbou na promotor místo na DNA, RNAP spolu s transkripční faktory tvoří přepis preiniciačního komplexu (PIC). To iniciuje proces transkripce.

místo promotoru je oblast umístěná proti proudu na 5′ konci řetězce DNA. AT-bohaté TATA box je nejvíce dobře-uznávaných promotor sekvence a je používán RNAP II. Nicméně, tento promotor se vyskytuje jen v přibližně 10-15% druhů savců.,

transkripční faktory, jako je TFIID, se váží na krabici TATA, což způsobuje dramatickou změnu tvaru dna. To umožňuje další proteiny sestavit v promotorovém místě s RNAP II, tvořící komplex iniciace transkripce (TIC).

Přidání fosfátové skupiny

Fosfátové skupiny jsou přidány na konec RNAP II TFIIH, uvolňuje enzym tak může zahájit proces transkripce. Transkripční faktory v místě promotoru jsou poté uvolněny a recyklovány, což jim umožňuje zahájit nové kolo transkripce., Fosfatáza odstraní fosfátové skupiny z RNAP II po dokončení procesu transkripce.

5′ Cap

RNA je omezena na konci 5′. Tento uzávěr se skládá z guaninu a methylové skupiny. RNA polyadenylace nastává na 3 ‚ konci, kde se do molekuly RNA přidávají adenosinmonofosfátové repetice, což vede k tvorbě poly a ocasu. To pomáhá hladkému přenosu mRNA z jádra, zvyšuje jeho životnost v buněčné cytoplazmě a zlepšuje její translační účinnost.,

Přepis Usnadněno RNA Polymeráza i a III

promotor sekvence spojené s syntézy rRNA je 150 párů bází na délku. Dva transkripční faktory, UBF a SL1 se vážou na promotéra a najímají RNAP i na web.

promotor sekvence používá RNAP III se liší od těch, které používají jiné polymeráz jako jsou vnitřní promotory, spíše než v těžební lokalitě. Transkripční faktor TFIIIC se váže na promotor umístěný v řetězci DNA a rekrutuje TFIIIB Před místo zahájení transkripce.,

následující události nejsou dobře charakterizovány, ačkoli bylo navrženo, že RNAP III se pomalu odděluje od svých transkripčních faktorů, což vede k pomalé clearance od místa zahájení.

další čtení

• Veškerý obsah RNA
• co je RNA?
• RNA Struktura
• Typy RNA: mRNA, rRNA a tRNA
• RNA Syntéza

citace