Obavy o přítomnosti ozbrojených vojáků ve městě by vedlo k obvinění z nátlaku, Paul se rozhodl odložit rady, dokud by mohl najít jiné místo. Vicenza souhlasil, že bude hostit radu v květnu 1538 a Paul povolal biskupy do města. Když přišlo málo biskupů, papež ještě jednou odložil radu. O tři roky později se papež Pavel III. a císař Karel V. setkali v Itálii, aby diskutovali o Radě, a císař navrhl císařské město Trent jako místo pro radu., Papež souhlasil a vydal býka Vyzývající k setkání rady v Trentu v listopadu 1542. Pokračující válka v Evropě však zabránila příchodu dostatečného počtu biskupů a rada byla opět pozastavena. Nakonec bylo dosaženo míru a rada byla zahájena 13.Prosince 1545.
Rada Trentu je jedním z nejdůležitějších setkání v historii Církve., Jmenuje definovat autentické Katolické nauky v reakci na Protestantské revoluci a ohlašovat období autentickou reformu, rada je sezení by span osmnácti let (vzhledem k dvěma zdlouhavé suspenze). Skutečná práce Rady však trvala čtyři a půl roku a zahrnovala tři pontifikáty. Rada vypracovala více vyhlášek a kánonů podle objemu než celá legislativa z předchozích osmnácti rad.
první setkání došlo od 1545-1547 a převážně zaměřena na stanovení postupů, které se využívají pro provádění koncilní podnikání., Prošel také vyhláškami týkajícími se Písma svatého a posvátné tradice, kánonu písma (sedmdesát tři knih obsažených v Vulgate), původního hříchu a ospravedlnění. Biskupové odmítli klíčovou protestantskou doktrínu ospravedlnění „samotné víry“ a prohlásili, že víra musí být doprovázena nadějí a láskou a ilustrována v životě prostřednictvím dobrých skutků. Rada také zahájila doktrinální revizi svátostí a definovala křest a potvrzení. Reformní dekrety zakázaly absentérství (biskupové nežijí ve své diecézi) a pluralismus (jeden člověk jako biskup více diecézí)., Bohužel, velká práce, kterou rada zahájila, byla pozastavena, když papežská armáda pochodující Trentem přinesla tyfus, takže několik biskupů onemocnělo a dokonce jednoho zabilo. Rada otcové hlasovali přesunout setkání do Boloně a sejdeme se opět za čtyřicet dní, ale navrhovaná změna v umístění tak hněval Karel V., že Paul III pozastavena rada na další čtyři roky.
Když rada svolána znovu, Papež Julius III (r. 1550-1555), který byl senior papežský legát na prvním zasedání Trent, uspěl Pavel III., V tomto druhém setkání biskupů potvrdil Katolické učení o Eucharistii, konkrétně nauce o transsubstanciaci, jakož i svátosti pokání a pomazání (pomazání nemocných). Další smířlivé pozastavení nastalo v roce 1552, kdy protestantská armáda dobyla Innsbruck, jen 110 mil od Trentu, a papež Julius se obával útoku na shromážděné biskupy. Před pokračováním práce rady by uplynulo celé desetiletí.
V uplynulých deseti letech, Papež Julius III. zemřel a byl následován Giovanni Angelo Medici, který přijal jméno Pius IV (r. 1559-1565)., Pius IV se zavázal k reformě a vyzval světové biskupy, aby se znovu shromáždili v Trentu na třetí zasedání Rady. Toto setkání bylo nejproduktivnější a dobře navštěvované, s více než 250 biskupy. V koncilní otcové předány dekrety o hierarchickou strukturu Církve, náboženský život, Očistec, uctívání relikvií, přímluvu svatých a odpustky. Rada se také zaměřila na výcvik a formování duchovenstva tím, že nařídila zřízení „semináře“ v každé diecézi v celé Církvi., Zneužívání duchovní tresty, jako exkomunikace a interdikt, pro politické účely byla řešena jako biskupové připomněli používat tyto sankce střídmě a pro správný účel.
Rada vyžadovala, aby biskupové žili ve své diecézi a nebyli nepřítomni déle než tři měsíce a nikdy během období adventu a půstu. Biskupové byli vyzváni, aby navštívili všechny farnosti v diecézi alespoň jednou ročně a kázali každou neděli. Unikátní ministerstvo římského papeže bylo zdůrazněno v reakci na protestantské útoky proti papežství., Za účelem oživení katolické spirituality požádali otcové rady o revizi a zveřejnění římského misálu a breviáře (Božského Úřadu). Otcové rady také požadovali vytvoření univerzálního katechismu, který by mohl být použit k výuce víry v boji proti chybám protestantismu.
po třech setkáních během osmnáctiletého období papež Pius IV. 4. prosince 1563 uzavřel radu a vyhlásil její dekrety. Trentská Rada zásadně změnila katolickou církev, která se stala živější, oddanější a zaměřila se na evangelizaci., Podle slov francouzský historik Henri Daniel-Rops, „Tam skutečně byl, v roce 1563, nový Katolické Církve, více jisti, že její dogma, více hoden vládnout duše, více vědomi její funkce a její povinnosti.”