V roce 1996, Borgnine hrál v televizním fantasy/thriller film Merlin ‚ s Shop of Mystical Wonders (částečně převzato z 1984 horor ďáblův Dar). Jako vypravěč a vypravěč, Borgnine líčí řetězec související nadpřirozené příběhy, jeho moderní bajky zejména centrování na kouzelné a nebezpečné činel-bouchání opice hračky ukradené z čaroděje Merlina. Film byl později uveden v parodickém televizním seriálu Mystery Science Theater 3000 a od té doby získal prominentní kultovní pokračování., Také v roce 1996 Borgnine cestoval po Spojených státech autobusem, aby se setkal se svými fanoušky a viděl zemi. Cesta byla předmětem dokumentu z roku 1997, Ernest Borgnine v autobuse. Jeden rok také sloužil jako předseda Národního pozdravu hospitalizovaným veteránům a navštěvoval pacienty v mnoha lékařských centrech pro záležitosti veteránů.
v roce 1997 se Borgnine objevil v adaptačním komediálním filmu McHale ‚ s Navy, kde hrál kontradmirál Quinton McHale, který byl také otcem postavy Toma Arnolda, Quinton McHale Jr.,
1999-2011: Poslední worksEdit
Spuštění v roce 1999, Borgnine za předpokladu, že jeho hlasový talent na animovaný seriál SpongeBob SquarePants jako starší superhrdina Mermaid Man (kde byl spárován s jeho McHale ‚ s Navy co-star Tim Conway jako hlas Mořská panna Muž je sidekick Barnacle Chlapec). Vyjádřil náklonnost k této roli, v nemalé části pro její popularitu mezi dětmi. Po jeho smrti Nickelodeon znovu vysílal všechny epizody, ve kterých se Mermaid Man objevil in memoriam., Borgnine se také objevil jako sám v epizodě Simpsonovi „Boy-Scoutz ‚ n The Hood“, kromě řady televizních reklam. V roce 2000 byl výkonným producentem Hoovera, ve kterém byl jediným oceněným hercem.
v roce 2007 si Borgnine zahrála v Hallmarkově originálním filmu Děda na Vánoce. Hrál muže, který poté, co jeho odcizená Dcera skončí v nemocnici kvůli autonehodě, zjistí, že má vnučku, o které nikdy nevěděl. Ona je vzata do jeho péče a brzy se stanou skvělými přáteli., Borgnine získal nominaci na Zlatý glóbus za Nejlepšího herce v Mini-seriálu nebo filmu vytvořeném pro televizi za svůj výkon. V 90 letech byl nejstarším kandidátem na Zlatý glóbus vůbec.
Borgninova autobiografie Ernie byla publikována Citadel Press v červenci 2008. Ernie je volná, konverzační vzpomínka na vrcholy z jeho herecké kariéry a pozoruhodné události z jeho osobního života.
2. dubna 2009 se objevil v poslední epizodě dlouhodobé lékařské série ER. Jeho role byla role manžela, jehož dlouhé manželství skončilo smrtí jeho ženy., Ve své poslední scéně je jeho postava v nemocničním lůžku ležícím vedle jeho právě zesnulé manželky. Jeho výkon získal cenu Emmy nominace za Vynikající Hostující Herec v dramatickém Seriálu, jeho třetí nominaci a jeho první v 29 letech (od té doby, co byl nominován za Vynikající Podporu Herce v Omezené Sérii, nebo Speciální v roce 1980 pro Všechny na Západní Frontě Klid).
V roce 2009, ve věku 92, on hrál jako Frank, hlavní postava Dalšího Harvest Moon, režie: Greg Swartz a také v hlavní roli Piper Laurie a Anne Meara., 2.října 2010 se Borgnine objevil jako sám v náčrtu s Morganem Freemanem v Saturday Night Live. 15. října 2010 se objevil v červené barvě, která byla natočena začátkem tohoto roku. Na konci roku 2011 Borgnine dokončil svůj poslední film, který hrál Rex Page v muži, který potřásl rukou Vicente Fernandeze.