în cauză prezența soldaților înarmați în oraș ar duce la acuzații de constrângere, Paul a decis să amâne Consiliul până când ar putea găsi o altă locație. Vicenza a fost de acord să găzduiască Conciliul în mai 1538, iar Pavel a chemat episcopi în oraș. Când au sosit puțini episcopi, Papa, încă o dată, a amânat Conciliul. Trei ani mai târziu, Papa Paul al III-lea și împăratul Carol al V-lea s-au întâlnit în Italia pentru a discuta despre consiliu, iar împăratul a sugerat orașul imperial Trent ca locație pentru Consiliu., Papa a fost de acord și a emis un taur care cerea Consiliului să se întâlnească la Trent în noiembrie 1542. Cu toate acestea, continuarea războiului în Europa a împiedicat sosirea unui număr suficient de episcopi, iar Conciliul a fost din nou suspendat. În cele din urmă, pacea a fost realizată și Consiliul a început la 13 decembrie 1545.Sinodul din Trent este una dintre cele mai importante întâlniri din istoria Bisericii., Chemat să definească doctrina catolică autentică ca răspuns la Revoluția protestantă și să introducă o perioadă de reformă autentică, ședințele Consiliului aveau să dureze optsprezece ani (din cauza a două suspendări îndelungate). Dar activitatea efectivă a Consiliului a durat patru ani și jumătate, cuprinzând trei pontificate. Consiliul a produs mai multe decrete și canoane în volum decât întreaga legislație din cele optsprezece consilii anterioare.
prima întâlnire a avut loc între 1545-1547 și s-a concentrat în principal pe stabilirea procedurilor de utilizare a activității conciliare., De asemenea, a adoptat decrete privind Sfânta Scriptură și Sfânta Tradiție, canonul Scripturii (cele șaptezeci și trei de cărți conținute în Vulgata), păcatul Original și justificarea. Episcopii au respins doctrina protestantă cheie a justificării „credinței singure”, declarând că credința trebuie să fie însoțită de speranță și iubire și ilustrată în viață prin fapte bune. Consiliul a început, de asemenea, o revizuire doctrinară a sacramentelor și a definit botezul și confirmarea. Decretele de reformă au scos în afara legii absenteismul (episcopii care nu trăiesc în Eparhia lor) și pluralismul (un om ca episcop al mai multor eparhii)., Din păcate, marea lucrare începută de Consiliu a fost suspendată atunci când o armată papală care mărșăluia prin Trent a adus tifos, lăsând mai mulți episcopi bolnavi și chiar ucigând unul. Părinții Consiliului au votat să mute reuniunea la Bologna și să se reunească în patruzeci de zile, dar schimbarea propusă a locației l-a înfuriat atât de mult pe Carol al V-lea, încât Paul al III-lea a suspendat Consiliul pentru încă patru ani.
atunci Când consiliul s-a întrunit din nou, Papa Iulius al III-lea (r. 1550-1555), care a fost senior legat papal la prima întâlnire de la Trent, a reușit Paul III., La această a doua întâlnire, episcopii au afirmat învățătura catolică despre Euharistie, în special doctrina transubstanțierii, precum și sacramentele penitenței și ungerii extreme (ungerea bolnavilor). O altă suspendare conciliară a avut loc în 1552, când o armată protestantă a cucerit Innsbruck, la numai 110 mile de Trent, iar Papa Iulius s-a temut de un atac asupra episcopilor adunați. Un deceniu întreg va trece înainte ca lucrările Consiliului să fie reluate.în deceniul care a urmat, Papa Iulius al III-lea a murit și a fost succedat de Giovanni Angelo Medici, care a luat numele de Pius al IV-lea (r. 1559-1565)., Hotărât să se reformeze, Pius al IV-lea i-a chemat pe episcopii lumii să se adune din nou la Trent pentru a treia reuniune a Sinodului. Această întâlnire a fost cea mai productivă și bine participată, cu peste 250 de episcopi. Părinții conciliari au emis decrete privind structura ierarhică a Bisericii, Viața religioasă, Purgatoriul, venerarea moaștelor, mijlocirea sfinților și indulgențele. Consiliul s-a concentrat, de asemenea, pe formarea și formarea clerului prin mandatarea înființării unui „seminar” în fiecare eparhie din întreaga Biserică., Abuzul de sancțiuni spirituale, cum ar fi excomunicarea și interzicerea, în scopuri politice a fost abordat, deoarece episcopilor li s-a reamintit să folosească aceste pedepse cu moderație și în scopul potrivit.Sinodul a cerut episcopilor să trăiască în Eparhia lor și să nu lipsească mai mult de trei luni și niciodată în anotimpurile Adventului și Postului Mare. Episcopii au fost îndemnați să viziteze toate parohiile din eparhie cel puțin o dată pe an și să predice în fiecare duminică. Lucrarea unică a Pontifului Roman a fost evidențiată ca răspuns la atacurile protestante împotriva papalității., Pentru a revigora spiritualitatea Catolică, părinții Consiliului au solicitat revizuirea și publicarea Misalului Roman și a breviarului (Biroul divin). Părinții Consiliului au cerut, de asemenea, crearea unui Catehism universal care ar putea fi folosit pentru a învăța credința pentru a combate Erorile protestantismului.după trei întâlniri pe o perioadă de optsprezece ani, Papa Pius al IV-lea a închis Conciliul la 4 decembrie 1563 și a promulgat decretele acestuia. Consiliul de la Trent a schimbat fundamental Biserica Catolică, care a devenit mai vibrantă, dedicată și concentrată pe evanghelizare., În cuvintele istoricului francez Henri Daniel-Rops, ” a existat într-adevăr, în 1563, o nouă biserică catolică, mai sigură de dogma ei, mai demnă de a guverna sufletele, mai conștientă de funcția și îndatoririle ei.”