wojna domowa i triumwirat
W roku 49, w którym wybuchła wojna domowa między Pompejuszem a Cezarem, Antoniusz był trybunem plebsu i energicznie wspierał Cezara. Uciekł z Rzymu do siedziby Cezara po otrzymaniu gróźb przemocy. Antoniusz walczył w krótkiej kampanii włoskiej, która zmusiła Pompejusza do ewakuacji półwyspu włoskiego. Po tym Cezar przekazał mu władzę we Włoszech podczas kampanii Hiszpańskiej., Następnie dołączył do Cezara w Grecji, dowodził jego lewym skrzydłem w bitwie pod Pharsalus i został odesłany z powrotem jako mistrz konia (zastępca dyktatora) w 48, aby utrzymać porządek we Włoszech. Nie udało mu się tego zrobić i prawdopodobnie został usunięty ze stanowiska w 47 r.; pozostawał bez zatrudnienia do 44 r., kiedy to został konsulem jako współpracownik i późniejszy kapłan (flamen) Cezara., Jako konsul i lupercus, jeden z celebrantów Święta Lupercalia (święto płodności na początku roku), zaoferował Cezarowi diadem – wstęgę oznaczającą królewską-której Cezar, naciskany przez otwarty niechęć obywateli do monarchii, odmówił przyjęcia.
po zamordowaniu Cezara Antoniusz zdobył w posiadanie skarbiec i papiery Cezara, które wykorzystał (i być może uzupełnił) na własną korzyść., Przez pewien czas prowadził umiarkowaną politykę, ale gdy został zakwestionowany przez 19-letniego Oktawiana (późniejszego cesarza Augusta), adoptowanego syna i dziedzica Cezara, zwrócił się przeciwko zabójcom Cezara. W czerwcu 44 Senat przyznał mu Północną i Środkową Galię oraz północne Włochy jako swoją prowincję na pięć lat. Cyceron jednak zaciekle zaatakował go w oracjach filipińskich między wrześniem 44 a kwietniem 43, A Oktawian połączył siły z konsulami w 43. Ich połączone siły dwukrotnie pokonały Antoniusza, który oblegał Brutusa Albinusa pod Mutiną (dzisiejsza Modena)., Antoniusz zdołał wycofać się do południowej Galii. Przeciwne armie rozpadły się po śmierci obu konsulów, a Antoniusz dołączył do nich marek Emiliusz Lepidus i Lucjusz Munatius Plancus ze swoimi armiami. Na początku listopada Oktawian-na czele wojsk konsularnych-spotkał się z Antoniuszem i Lepidusem w Bononii (dzisiejsza Bolonia). Trzy osoby zawarły pięcioletni pakt, który wkrótce został ratyfikowany przez prawo, przyznając im wspólną autokrację, triumwirat., Ponad 200 mężczyzn zostało skazanych i (po schwytaniu) zabitych (Cyceron był jednym z nich), albo dlatego, że byli wrogami triumwirów, albo w celu konfiskaty ich bogactwa. W 42 roku Gajusz Kasjusz i marek Brutus, pokonani w dwóch bitwach pod Filippi (Macedonia), w których Antoniusz wyróżnił się jako dowódca, zabili siebie i, dzięki tym działaniom, sprawę Republikańską.
triumwirowie zgodzili się na podział Imperium, więc Antoniusz przystąpił do zarządzania wschodnimi prowincjami. Po raz pierwszy wezwał Kleopatrę, królową Egiptu, do Tarsu (Południowo-Wschodnia Azja Mniejsza), aby odpowiedzieć na doniesienia, że pomogła ich wrogom. Została oczyszczona z zarzutów, a Antoniusz spędził zimę 41-40 roku jako jej kochanek w Aleksandrii w Egipcie., Pomimo romantycznych relacji starożytnych autorów, nie zrobił jednak żadnego ruchu, aby zobaczyć ją ponownie przez ponad trzy lata, chociaż znacznie zwiększył jej posiadłości terytorialne w tym okresie.
na początku 40 roku brat Antoniusza, Konsul Lucjusz Antoniusz, wspierany przez żonę Antoniusza, Fulwię, zbuntował się przeciwko Oktawianowi we Włoszech. Oktawian pokonał rebelię, zdobywając i niszcząc Peruzję (dzisiejsza Perugia). Antoniusz musiał wrócić do Italii, pozostawiając swojego generała Ventidiusza, by zajął się inwazją Partów na Azję Mniejszą i Syrię., Po początkowych potyczkach Antoniusz i Oktawian pogodzili się w Brundisium (dzisiejsze Brindisi), a ponieważ Fulvia zmarła w międzyczasie, Antoni ożenił się z siostrą Oktawiana, Oktawią. Obaj panowie podzielili między siebie Imperium, Oktawian zajął wszystko na zachód od Scodry (dzisiejsze Shkodër, Alb.) i Antoniusz na wschód. Lepidus, który wcześniej był ograniczony do Afryki, mógł go zatrzymać. W 39 Antoniusz i Oktawian zawarli Traktat z Sekstusem Pompejuszem (zob. Pompejusz Magnus Pius, Sekstus), który kontrolował morza i blokował Italię.,
Antoniusz i Oktawia udali się do Aten, gdzie zostali deifikowani; Antoniusz został ogłoszony nowym Dionizosem, mistycznym Bogiem wina, szczęścia i nieśmiertelności. Antoniusz zorganizował wtedy Wschód. Wendiusz tymczasem wypchnął Partów z Azji Mniejszej w 40 roku i wypędził ich za rzekę Eufrat(39-38). Herod-syn wybitnego palestyńskiego żydowskiego przyjaciela Rzymu, Antypatra – został ustanowiony w Jerozolimie jako król Judei w 37 roku. Kiedy Oktawian miał problemy we Włoszech i na Zachodzie w 37 roku, Antoniusz spotkał się z nim w Tarentum, zaopatrzył go w statki i zgodził się odnowić triumwirat na kolejne pięć lat., Lepidus być może nie został uwzględniony. W 36 roku generał Oktawiana marek Wipsaniusz Agryppa pokonał Sekstusa Pompejusza. Następnie Lepidus i Oktawian anektowali Afrykę. Oktawia, przebywająca w Rzymie od 37 roku, została wysłana do Antoniusza przez Oktawiana w 35 roku. Antoniusz odesłał ją z powrotem, ponieważ przybyła z prawie żadnym z oddziałów, które Antoniusz pożyczył Oktawianowi. Długo przygotowywany atak na partię w 36 R. nie powiódł się, z dużymi stratami—była to pierwsza porażka militarna Antoniusza. W tym momencie zwrócił się ponownie do Kleopatry, która urodziła mu dwoje dzieci i dała mu pełne wsparcie polityczne i finansowe.