Koptyjski Kościół Ortodoksyjny Aleksandrii, zwany także koptyjskim Kościołem ortodoksyjnym, orientalny Kościół Ortodoksyjny i Główny Kościół chrześcijański w przeważnie muzułmańskim Egipcie. Ludność Egiptu przed podbojem arabskim w VII wieku określiła siebie i swój język w języku greckim jako Aigyptios (Arabski qibṭ, Zachodnio-Kopt). Kiedy egipscy muzułmanie później przestali nazywać siebie Aigyptioi, termin stał się charakterystyczną nazwą mniejszości chrześcijańskiej., W XIX i XX wieku zaczęli nazywać się Koptyjscy prawosławni, aby odróżnić się zarówno od Koptów, którzy nawrócili się na katolicyzm (Zobacz też Koptyjski Kościół katolicki), jak i od prawosławnych, którzy w większości są Grekami (Zobacz też Grecki Patriarchat Aleksandrii).
w IV i V wieku powstał konflikt Teologiczny między Koptami a grecko-języcznymi Rzymianami, czyli Melchitami w Egipcie. Sobór w Chalcedonie (451) odrzucił doktrynę monofizycką-przekonanie, że Jezus Chrystus ma tylko boską, a nie ludzką naturę—i potwierdził zarówno jego boskość, jak i jego człowieczeństwo. Melchici uznali wynik chalcedonu., Kościół Koptyjski stał się jednak jednym z kilku kościołów wschodnich, które odrzuciły język Chrystologiczny o dwóch Naturach Chrystusa uzgodnionych w Chalcedonie. Jednak podczas gdy kościoły rzymskokatolickie i prawosławne potępiały te kościoły wschodnie jako heretyków monofizyckich, Kościół Koptyjski i inne przed Chalcedońskie lub (od XX wieku) orientalne kościoły ortodoksyjne przyjęły stanowisko teologiczne zwane miafizytyzmem. Spowiedź św. Cyryla Aleksandryjskiego (ok., 375-444) głosząc” jedną inkarnowaną naturę Słowa Bożego”, miafizyci oświadczyli, że zarówno człowieczeństwo Chrystusa, jak i boskość są na równi obecne poprzez wcielenie w jednej naturze (stąd Grecki przedrostek mia, „ten sam”), co Słowo stało się ciałem. Zamiast zaprzeczać człowieczeństwu Chrystusa, o co zostali oskarżeni, kościoły koptyjskie i inne kościoły miafizyckie dały zarówno jego człowieczeństwo, jak i jego boskość równą obecności w osobie Chrystusa.
Po arabskim podboju Egiptu w VII wieku Koptowie przestali mówić po grecku, a bariera językowa dodała kontrowersji., Różne próby kompromisu ze strony cesarzy bizantyjskich okazały się bezskuteczne. Później Arabscy kalifowie, choć skłonni byli faworyzować tych, którzy przyjęli Islam, nie ingerowali zbytnio w wewnętrzne sprawy Kościoła. Dżizja, podatek nakładany na nie-muzułmanów żyjących w Państwie Islamskim, został zniesiony w XVIII wieku.
arabski jest obecnie używany w nabożeństwach Koptyjskiego Kościoła Ortodoksyjnego do lekcji z Biblii i wielu różnych hymnów; tylko niektóre krótkie refreny, które wszyscy ludzie Kościoła rozumieją, nie są w języku arabskim. Księgi nabożeństw, posługując się liturgiami przypisywanymi św., Marek, św. Cyryl z Aleksandrii i św. Grzegorz z Nazjanzu są pisane w języku koptyjskim (dialekt Aleksandryjski), z tekstem arabskim w równoległych kolumnach.
Koptyjski Kościół Ortodoksyjny rozwinął demokratyczny system rządów PO latach 90., Patriarcha i 12 Biskupów Diecezjalnych, z pomocą rad wspólnoty, w których świeccy są dobrze reprezentowani, regulują Finanse kościołów i szkół oraz zarządzanie zasadami dotyczącymi małżeństw, dziedziczenia i innych spraw o statusie osobistym. Po śmierci patriarchy Kolegium Elektorskie, składające się głównie z świeckich, wybiera trzech odpowiednio wykwalifikowanych mnichów w wieku co najmniej 50 lat jako kandydatów na urząd patriarchy. Spośród tych trzech, ostateczny wybór dokonywany jest przez los po modlitwie.,
najwyższym rangą biskupem jest patriarcha Aleksandrii, który mieszka w Kairze; nazywany jest papieżem i domaga się władzy Apostolskiej na swój urząd od św. Marka. Kościół posiada własne szkoły podstawowe i średnie w wielu miejscach w Egipcie, a także silny ruch szkółek niedzielnych na rzecz edukacji religijnej dzieci niezdolnych do chodzenia do szkół koptyjskich., W Kairze znajduje się Instytut Studiów koptyjskich, kolegium teologiczne połączone z Instytutem i Muzeum Koptyjskie; nauczanie Koptyjskiego Kościoła Ortodoksyjnego stało się nawet podstawą programu nauczania stosowanego w nauczaniu religijnym dzieci chrześcijańskich w szkołach rządowych.
w Jerozolimie i na innych obszarach Ziemi Świętej znajdują się Koptyjskie kościoły prawosławne, zbudowane w XIX i XX wieku, a także Koptyjskie biskupstwo w Chartumie w Sudanie. Kościół ma również niewielką obecność w Ameryce Północnej, Australii i Wielkiej Brytanii., Etiopskie, ormiańskie i syryjskie kościoły ortodoksyjne są orientalnymi kościołami ortodoksyjnymi w komunii z koptyjskim Kościołem ortodoksyjnym. Orientalne kościoły prawosławne były przez wieki uważane za heretyckie przez kościoły rzymskokatolickie i prawosławne. Jednak od końca XX wieku Koptyjski Kościół Ortodoksyjny, podobnie jak inne orientalne kościoły ortodoksyjne, wszedł w dialog z obydwoma, rozwiązując wiele sporów teologicznych i zdobywając uznanie jako doktrynalny w głównym nurcie ortodoksyjnego chrześcijaństwa.