Cousteau jest synem Jacques-Yves Cousteau i Simone Melchior. Cousteau po raz pierwszy nurkował z aqua-lung w 1945 roku, gdy miał 7 lat. Chociaż uczęszczał do szkoły, aby studiować architekturę, dołączył do towarzystwa Cousteau swojego ojca, służąc przez dwadzieścia lat jako wiceprezes wykonawczy, zanim w 1993 roku zaczął samodzielnie produkować filmy środowiskowe. Cousteau i jego ojciec nie zgadzali się co do zarządzania i polityki społeczeństwa.,
Po tym, jak Cousteau otworzył Ośrodek wypoczynkowy na wyspie Fidżi, W 1996 roku Jacques-Yves Cousteau złożył przeciwko niemu pozew. W czerwcu 1996 roku sąd podpisał nakaz nakazujący mu dodanie, z równym wyeksponowaniem, swojego imienia do hotelu. Jean-Michel założył w 1999 roku Ocean Futures Society, organizację zajmującą się ochroną i edukacją morską., W 2003 roku Francesca Sorrenti i Marisha Shibuya z projektu SKE GROUP, we współpracy z Towarzystwem Ocean Futures Jeana-Michela Cousteau, współpracowali przy tworzeniu Water Culture, publikacji Trolley Books, zawierającej wiele różnych zdjęć związanych z wodą fotografa i wywiadów z wybitnymi osobistościami świata na temat problemów, przed którymi stoi nasze zaopatrzenie w wodę. Cousteau jest również prezesem Green Cross France. Cousteau opowiada się za światem wolnym od broni jądrowej i jest członkiem Rady Doradczej Nuclear Age Peace Foundation.,
Cousteau pracuje nad dokumentem podkreślającym Epicki i katastrofalny wyciek ropy w Zatoce Perskiej w 2010 roku, w którym 11 pracowników zginęło podczas eksplozji platformy wiertniczej 50 mil (80 km) u wybrzeży Luizjany w Stanach Zjednoczonych.
w 2012 roku opublikował książkę mój ojciec, Kapitan: moje życie z Jacques ' em Cousteau.
Jean-Michel Cousteau jest prezydentem Green Cross France& Territoires, organizacji pozarządowej proponującej Klucze do działań na rzecz lepszego środowiska dla wolnej przyszłości.,
produkcja i występy Filmowedytuj
wyprodukował ponad 70 filmów. W 2003 roku wystąpił w filmie dokumentalnym IMAX Coral Reef Adventure.
pojawił się w specjalnym filmie dokumentalnym Case of the Sponge „Bob”, w wersji DVD filmu SpongeBob Kanciastoporty (2004), w którym on i Stephen Hillenburg opowiadają o wszystkich prawdziwych odpowiednikach morskich stworzeń widzianych w serialu i filmie. W 2004 roku wystąpił w filmie Disneya/Pixara Finding Nemo: Exploring the Reef (odkrywanie rafy) z Jeanem-Michelem Cousteau., W wydaniu DVD Disneya z Finding Nemo, Cousteau pojawia się w interakcji z postaciami z filmu, Marlin, Nemo i Dory, i reklamuje potrzebę lepszej kontroli zanieczyszczeń, pokazując filmy zanieczyszczonych raf koralowych.
Jean-Michel Cousteau nakręcił nowy serial dokumentalny Ocean Adventures wydany w 2006 roku. Cousteau ' s Ocean Futures Society, KQED i PBS kontynuują produkcję serii Ocean Adventures na lata 2007 i 2008. W październiku 2006 roku Jean-Michel Cousteau wraz z ekipą ekspedycyjną, w skład której wchodzi jego syn Fabien i córka Céline, rozpoczęli filmowanie wzdłuż rzeki Amazonki., Dwadzieścia lat temu naukowcy przewidzieli tutaj dewastację i nieodwracalne szkody w środowisku, a 25 lat temu Jean-Michel Cousteau i jego legendarny ojciec podróżowali ze swoimi zespołami przez całą długość Amazonii, aby udokumentować, dowiedzieć się i zobaczyć na własne oczy.
w 2006 roku dokumentalna podróż Cousteau do Kure zainspirowała ówczesnego prezydenta USA George ' a W. Busha do ochrony morskiego Pomnika Narodowego Papahānaumokuākea, czyniąc go—ze swoimi 140 000 mil kwadratowych (360 000 km2) wód oceanicznych, wysp i atoli—jednym z największych morskich obszarów chronionych na świecie.