Phylogenie, die Geschichte der Evolution einer Art oder Gruppe, insbesondere in Bezug auf Abstammungslinien und Beziehungen zwischen breiten Gruppen von Organismen.
Grundlegend für die Phylogenie ist der in der wissenschaftlichen Gemeinschaft allgemein akzeptierte Satz, dass Pflanzen oder Tiere verschiedener Arten von gemeinsamen Vorfahren abstammen. Die Beweise für solche Beziehungen sind jedoch fast immer unvollständig, denn die überwiegende Mehrheit der Arten, die jemals gelebt haben, sind ausgestorben, und relativ wenige ihrer Überreste sind im Fossilienbestand erhalten geblieben. Die meisten Phylogenien sind daher Hypothesen und basieren auf indirekten Beweisen. Verschiedene Phylogenien entstehen oft mit den gleichen Beweisen., Dennoch besteht allgemeine Übereinstimmung darüber, dass der Baum des Lebens das Ergebnis organischer Abstammung früherer Vorfahren ist und dass wahre Phylogenien zumindest im Prinzip erkennbar sind.