Bürgerkrieg und Triumvirat
In 49, dem Jahr, in dem der Bürgerkrieg zwischen Pompejus und Caesar ausbrach, war Antonius Tribun der Plebs und unterstützte Caesar energisch. Er floh aus Rom in Caesars Hauptquartier, nachdem er Gewaltandrohungen erhalten hatte. Antony kämpfte in der kurzen italienischen Kampagne, die Pompeius zwang, die italienische Halbinsel zu evakuieren. Danach verließ Caesar ihn während des spanischen Feldzugs für Italien., Dann schloss er sich Caesar in Griechenland an, befahl seinen linken Flügel in der Schlacht von Pharsalus und wurde 48 als Meister des Pferdes (der zweite Befehlshaber eines Diktators) zurückgeschickt, um die Ordnung in Italien zu halten. Er versagte dies und wurde wahrscheinlich von seinem Posten in 47 entfernt; er war ohne Beschäftigung bis 44, als er Konsul als Kollege und später Priester (Flamen) von Caesar wurde., Als Konsul und Lupercus, einer der Zelebranten des Festivals der Lupercalia (ein Fruchtbarkeitsfest zu Beginn des Jahres), bot er Caesar ein Diadem an—ein Band, das Königtum bedeutet—, das Caesar, unter Druck gesetzt von der offenen Abneigung der Bürger gegen die Monarchie, ablehnte zu akzeptieren.
Nach Caesars Ermordung erlangte Antonius den Besitz der Schatzkammer und von Caesars Papieren, die er zu seinem eigenen Vorteil verwendete (und vielleicht ergänzte)., Eine Zeit lang verfolgte er eine gemäßigte Politik, aber als er von dem 19-jährigen Octavian (später Kaiser Augustus), Caesars Adoptivsohn und Erbe, herausgefordert wurde, wandte er sich gegen Caesars Mörder. Im Juni 44 gewährte ihm der Senat Nord-und Mittelgallien und Norditalien als seine Provinz für fünf Jahre. Cicero griff ihn jedoch in den philippischen Reden zwischen September 44 und April 43 heftig an, und Octavian schloss sich 43 mit den Konsuln zusammen. Ihre vereinten Kräfte besiegten zweimal Antony, der Brutus Albinus in Mutina (heutiges Modena) belagerte., Antony schaffte es, sich in Südgallien zurückzuziehen. Die gegnerischen Armeen lösten sich nach dem Tod beider Konsuln auf, und Antony wurde von Marcus Aemilius Lepidus und Lucius Munatius Plancus mit ihren Armeen verbunden. Anfang November traf Octavian—zu diesem Zeitpunkt an der Spitze der Konsularararmeen—Antonius und Lepidus in Bononia (heutiges Bologna). Die drei schlossen einen Fünfjahrespakt, der bald durch ein Gesetz ratifiziert wurde und ihnen eine gemeinsame Autokratie, das Triumvirat, verlieh., Mehr als 200 Männer wurden verbannt und (wenn sie gefangen genommen wurden) getötet (Cicero war einer von ihnen), entweder weil sie Feinde der Triumviren waren oder um ihren Reichtum zu beschlagnahmen. In 42 Gaius Cassius und Marcus Brutus, besiegt in zwei Schlachten in Philippi (Mazedonien), in denen sich Antonius als Kommandant auszeichnete, töteten sich und mit diesen Taten die republikanische Sache.
Die Triumviren hatten zugestimmt, das Reich zu teilen, also übernahm Antonius die Verwaltung der östlichen Provinzen. Er rief zuerst Kleopatra, die Königin von Ägypten, nach Tarsus (Südostasien), um Berichte zu beantworten, dass sie ihren Feinden geholfen hatte. Sie entlastete sich erfolgreich und Antonius verbrachte den Winter 41-40 als ihr Geliebter in Alexandria, Ägypten., Trotz der romantischen Berichte antiker Autoren machte er jedoch mehr als drei Jahre lang keinen Schritt, sie wiederzusehen, obwohl er ihren territorialen Besitz in dieser Zeit stark vergrößerte.
Anfang 40 rebellierte Antonius Bruder, der Konsul Lucius Antonius, unterstützt von Antonius Frau Fulvia, gegen Octavian in Italien. Octavian besiegte die Rebellion und eroberte und zerstörte Perusia (heutiges Perugia). Antony musste nach Italien zurückkehren und seinen General Ventidius verlassen, um sich mit einer parthischen Invasion Kleinasiens und Syriens zu befassen., Nach anfänglichen Scharmützeln versöhnten sich Antonius und Octavian am Brundisium (heute Brindisi) und seit Fulvia in der Zwischenzeit gestorben war, heiratete Antonius Octavians Schwester Octavia. Die beiden Männer teilten das Reich zwischen ihnen auf und Octavian nahm alles westlich von Scodra (heutiges Shkodër, Alb.) und Antony alles east. Lepidus, der früher nach Afrika beschränkt war, durfte es behalten. 39 schlossen Antonius und Octavian einen Vertrag mit Sextus Pompeius (siehe Pompeius Magnus Pius, Sextus), der die Meere kontrollierte und Italien blockiert hatte.,
Antonius und Octavia gingen nach Athen, wo sie vergöttert wurden; Antonius wurde zum Neuen Dionysos, mystischen Gott des Weins, des Glücks und der Unsterblichkeit erklärt. Antonius organisierte dann den Osten. Ventidius, inzwischen, schob die Parther aus Kleinasien in 40 und trieb sie zurück über den Euphrat (39-38). Herodes—der Sohn eines prominenten palästinensischen jüdischen Freundes von Rom, Antipater-wurde 37 in Jerusalem als König von Judäa gegründet. Als Octavian 37 in Italien und im Westen Probleme hatte, traf Antonius ihn in Tarentum, versorgte ihn mit Schiffen und erklärte sich bereit, das Triumvirat für weitere fünf Jahre zu erneuern., Lepidus war vielleicht nicht enthalten. Im Jahr 36 besiegte Octavians General Marcus Vipsanius Agrippa Sextus Pompeius. Dann annektierten Lepidus und Octavian Afrika. Octavia, der seit 37 in Rom war, wurde 35 von Octavian nach Antonius geschickt. Antony schickte sie zurück, weil sie mit fast keiner der Truppen ankam, die Antony Octavian geliehen hatte. Ein lang vorbereiteter Angriff auf Parthia in 36 scheiterte mit schweren Verlusten—es war Antonius erster militärischer Misserfolg. Zu diesem Zeitpunkt wandte er sich erneut an Kleopatra, die ihm zwei Kinder geboren und ihm volle politische und finanzielle Unterstützung gegeben hatte.