グナエウス-ポンペイウスは、ポンペイウス大王（グナエウス-ポンペイウス-マグヌス）の三女ムキア-テルティアの長男である。 彼と彼の弟のセクストゥス-ポンペイウスは、ローマの最高の将軍の一人であり、もともと保守的な政治家ではなく、ユリウス-カエサルが脅威になったときに、より伝統的な派閥に漂流した父親の影で育った。 紀元前49年にカエサルがルビコン川を渡って内戦を開始すると、グナエウスは父に従って東へ逃れた。, ポンペイウス軍は紀元前48年にファルサルスの戦いに敗れ、ポンペイウス自身は命を落とさなければならず、同年29月にエジプトで殺害された。
殺人の後、グナエウスと彼の兄弟セクストゥスは、アフリカの州でカエサルに対する抵抗に加わりました。 メテッルス-スキピオ、カトー-ザ-ヤンガー、その他の上院議員とともに、彼らはカエサルと彼の軍隊に最後まで反対する準備をした。 カエサルは紀元前46年のタプソスの戦いでメテッルス-スキピオとカトを破り、その後自殺した。 グナエウスは今度はバレアレス諸島に逃れ、そこでセクストゥスに加わった。, カエサル軍の元将軍ティトゥス-ラビエヌスとともに、ポンペイウス兄弟はヒスパニア（現在のスペインとポルトガルを含むイベリア半島）に渡り、そこでさらに別の軍隊を挙げた。
カエサルはすぐに続き、紀元前17月45日、軍はムンダの戦いで会った。 両軍は大きく、有能な将軍によって導かれました。 この戦いは密接に戦われたが、最終的にはカエサルによる騎兵の突撃が彼の側に回った。 この戦いとその後のパニックに陥った脱出では、ティトゥス-ラビエヌスとポンペイウス側の推定30,000人が死亡した。, Gnaeus、セクストスの時代の思想状況を他の時間もサポーターを作ってみました。 それは今では明らかだったシーザーは内戦に勝った。 数週間以内に、グナエウス-ポンペイウスはルキウス-カエセニウス-レントに追い詰められ、殺された。 セクストゥス-ポンペイウスは敵の一歩先を行くことができ、彼の兄弟を別の十年にわたって生き残った。