市内に武装した兵士の存在が強制の罪につながることを懸念し、ポールは別の場所を見つけることができるまで評議会を延期することにしました。 ヴィチェンツァは1538年に評議会を開催することに同意し、パウロは司教を街に呼び出した。 いくつかの司教が到着したとき、教皇は、再び、評議会を延期しました。 三年後、教皇パウロ三世と皇帝シャルルVは、評議会を議論するためにイタリアで会った、と皇帝は評議会のための場所としてトレントの帝国都市を, 教皇は1542年にトレントで会うことに同意し、議会を求める雄牛を発行した。 しかし、ヨーロッパでの戦争が続いたため、十分な数の司教が到着することができず、評議会は再び中断されました。 やがて和平が達成され、天文13年（1545年）に評議会が開始された。
トレント評議会は教会史上最も重要な集会の一つです。, プロテスタント革命に対応して本物のカトリックの教義を定義し、本物の改革の期間の到来を告げるために呼び出され、評議会のセッションは（二つの長い中断のために）十八年にまたがるだろう。 しかし、評議会の実際の仕事は、三つの教皇を包含する、四年半かかりました。 理事会は、以前の十八協議会からの全体の法律よりもボリュームによってより多くの法令と規範を生成しました。
最初の会議は1545年から1547年にかけて行われ、主に融和ビジネスを行うために利用する手順の確立に焦点を当てました。, また、聖書と神聖な伝統、聖書のカノン（ヴァルガトに含まれる七十から三書）、原罪、義認に関する法令を通過しました。 司教たちは、信仰は希望と愛を伴わなければならず、良い行いを通して人生に示されなければならないと宣言し、”信仰のみ”正当化の重要なプロテスタントの教義を拒否しました。 評議会はまた、聖餐の教義的な見直しを始め、バプテスマと確認を定義しました。 改革令は、欠勤（教区に住んでいない司教）と多元主義（複数の教区の司教としての一人の男）を禁止しました。, 残念なことに、評議会によって始められた偉大な仕事は、トレントを通って行軍する教皇軍がチフスをもたらし、何人かの司教を病気にし、一人を殺したときに中断された。 議会の父親は四十日でボローニャとreconveneに会議を移動することを投票しました,しかし、場所の提案された変更は、そのようにポールIIIは、さらに四年間評議会を中断しているチャールズVを怒らせました.
評議会が再び招集されたとき、トレントの最初の会議で上級教皇のlegateであった教皇ユリウス三世（r.1550-1555）は、パウロ三世の後を継いだ。, この第二の会議では、司教は、聖体、特にtransubstantiationの教義だけでなく、苦行と極端なunction（病人の油注ぎ）の秘跡にカトリックの教えを確認しました。 1552年、プロテスタント軍がトレントからわずか110マイルのインスブルックを征服し、教皇ユリウスが集まった司教に対する攻撃を恐れたときに、別の融和的な中断が起こった。 全体の十年という前理事会の活動を再開します。
間の十年では、教皇ユリウスIIIが死亡し、名前ピウスIV（r.1559-1565）を取ったジョヴァンニ*アンジェロ*メディチによって継承されました。, 改革に取り組んで、ピウスIVは、評議会の第三回会合のためにトレントに再び集まるために世界の司教を呼び出しました。 この集会は最も生産的で，250人以上の司教たちが出席しました。 懐柔的な父親は、教会の階層構造、宗教的生活、煉獄、遺物の崇拝、聖人の執り成し、および寛容に関する法令を通過しました。 評議会はまた、教会全体の各教区に”神学校”を設立することを義務付けることによって、聖職者の訓練と形成に焦点を当てました。, 司教はこれらの罰則を控えめに、適切な目的のために使用するように思い出させたとして、このような破門や禁止などの精神的な罰則の乱用は、政治
評議会は、司教が彼らの教区に住んでいると三ヶ月以上のために不在ではなく、アドベントと四旬節の季節の間に決してないことを要求しました。 司教は、少なくとも年に一度は教区のすべての教区を訪問し、毎週日曜日に説教するよう勧められました。 ローマ教皇のユニークなミニストリーは、ローマ教皇に対するプロテスタントの攻撃に応じて強調されました。, カトリックの精神性を再活性化するために、評議会の父親は、ローマのMissalとBreviary（神のオフィス）の改訂と出版を要求しました。 評議会の父親はまた、プロテスタントの誤りに対抗するために信仰を教えるために使用できる普遍的な教理の創造を要求しました。
教皇ピウス4世は1563年に評議会を閉鎖し、その法令を公布した。 トレントの評議会はカトリック教会を根本的に変え、より活気に満ち、献身的になり、福音化に焦点を当てました。, フランスの歴史家アンリ-ダニエル-ロップスの言葉では、”1563年には、彼女の教義をより確実にし、魂を支配する価値があり、彼女の機能と職務をより意識していた新しいカトリック教会が実際にあった。”