私たちの肺は懸命に働きます。 平均寿命では、人間の肺は20-40万回の呼吸を取り、7000と10,000リットルの間の毎日の気流を経験します。 哺乳類の肺は二つの異なる領域から構成されています：
1. 気管、気管支、および細気管支を含む伝導性気道管。
2. ガス交換領域、または肺胞スペース。
科学者たちは、これらの領域にそれぞれ独自のタイプの幹細胞が含まれていることを発見しました。, 正常な肺では、多くの幹細胞が各領域全体に存在する。 これらの細胞は、肺を健康に保つ古いまたは損傷した肺細胞を置き換えるために分裂する。 幹細胞には、気管基底細胞、細気管支分泌細胞（club細胞として知られている）、および肺胞2型細胞が含まれる。 これらの幹細胞の分裂は、正常な成人生活を通じて肺の構造を更新するのに十分であると考えられている。
肺疾患では、これらのプロセスが変化し、したがって、損傷後に産生される機能細胞が少なくなります。, これは、患者の体に酸素を供給する肺の能力が時間の経過とともに減少し、病気を引き起こし、最終的には死を引き起こすことを意味する。
例えば、COPDのような慢性肺疾患を有する患者の肺は、特にタバコの煙に曝された後、気道および肺胞において変化を示す。 COPD患者の大きな気道は、基底細胞過形成（基底細胞の数の増加）、繊毛細胞の喪失および粘液分泌杯細胞の数の増加を示す。 COPD肺の肺胞には、より少ない肺胞I型細胞が存在する。, 健康な肺では、肺胞II型細胞はI型細胞を作ることができ、このプロセスはCOPD肺ではまだ起こるが、もはや効率的ではない。 幹細胞を取り巻く環境も病気によって変わります。 COPD肺の肺胞にはより活性化されたマクロファージと線維芽細胞があり、これらの周囲の細胞は幹細胞の挙動を変えるシグナルを提供することが
いくつかの幹細胞は、初期肺の発達に寄与し、他の幹細胞は、生涯を通じて肺を修復し、再生するのに役立ちます。 幹細胞の問題は、肺疾患に寄与する可能性があります。 マウス肺では、伝導性気道管に位置するまれな幹細胞が発見されている。, 重度の傷害（例えば、インフルエンザ感染）に応答して、これらの稀な幹細胞は、気道およびガス交換領域の両方に寄与する新しい細胞を分裂および産生 これらの細胞はまた実験室で育てられ、傷つけられたマウスの肺で処置として使用されました。 しかし、これらのまれな幹細胞がヒト肺において重要であるかどうかはまだ明らかではない。