MSでは、msによって引き起こされる中枢神経系の損傷または瘢痕化（硬化症）の領域を指す病変は、プラークとも呼ばれ、神経周囲のミエリン鞘を攻撃する免疫系に起因する炎症によって引き起こされる。
MRIスキャンは、活動性病変と非活動性病変を区別することができる。 活動性病変は、ガドリニウムを含む造影剤が注入されると、白い斑点としてスキャンに現れる。 病変が点灯しない場合、それはより古い病変であり、3ヶ月以上である可能性が高い。,
定期的なスキャンでは、神経科医はあなたのMSがどれほど活発であり、どの程度まであなたの神経が損傷しているかを知ることができます。 時には、病変は自分自身を修復し、その後のスキャンでは見られません。 永続的な病変は、最終的には”ブラックホール”として現れることがあり、根底にあるニューロンは修復不能な損傷を受けている。
病変は、症状を経験する前、または最初のCISでMRIスキャンで検出することができます。 これらは”静かな”病変として知られています。, 特定の障害を特定の病変に帰することは困難であり、もちろん、病変は脳卒中や片頭痛などの他の疾患、および老化によっても引き起こされ得る。
MRIスキャンで見られる病変の存在、分布およびタイプは、神経科医がMSの診断を行うことができるようにするための有用な手がかりである。