a Pásztázó elektronmikroszkóp (SEM), írja be az elektron-mikroszkóp, úgy tervezték, hogy közvetlenül tanulmányozza a felületek szilárd tárgyat, hogy hasznosítja a fény, a koncentrált elektronok viszonylag alacsony energiájú elektron szonda beszkennelt rendszeres módon a minta. A fénysugarat létrehozó és fókuszáló elektronforrás és elektromágneses lencsék hasonlóak a transzmissziós elektronmikroszkóp (TEM) esetében leírtakhoz., The action of the electron beam stimulates emission of high-energy backscattered electrons and low-energy secondary electrons from the surface of the specimen.
© David Gregory & Debbie Marshall, Wellcome Images/Wellcome Library, London (CC BY 4.,0)
Nem bonyolult minta-előkészítés technikák szükségesek a vizsgálat az SEM, pedig nagy, terjedelmes példányok is elhelyezkedhetnek. Kívánatos, hogy a mintát elektromosan vezessék; ellenkező esetben éles képet nem kapunk., A vezetőképességet általában egy fémfólia, például arany elpárologtatásával érik el, 50-100 szögvastagság vastag vákuumban a mintára (ilyen vastagság nem befolyásolja lényegesen a felületi részletek felbontását). Ha azonban a SEM 1-3 kilovolt energia mellett működtethető, akkor még a nem vezető mintákat is meg lehet vizsgálni fémbevonat nélkül.,
a szkennelési eszközöket a TEM-ekkel kombinálták a szkennelési átviteli elektronmikroszkópok létrehozásához., Ezeknek az az előnye, hogy a nagyon vastag metszeteket kromatikus aberrációs korlátozás nélkül lehet tanulmányozni, és elektronikus módszereket lehet alkalmazni a kép kontrasztjának és fényerejének fokozására.