polgárháború és triumvirátus
49-ben, abban az évben, amikor a polgárháború kitört Pompeius és Caesar között, Antonius a plebs tribunusa volt és erőteljesen támogatta Caesart. Rómából Caesar főhadiszállására menekült, miután erőszakos fenyegetéseket kapott. Antonius harcolt a rövid olasz kampányban, amely arra kényszerítette Pompey-t, hogy evakuálja az olasz félszigetet. Ezt követően Caesar a spanyol kampány során Itáliát bízta meg., Ezután Görögországba csatlakozott Caesarhoz, a Farsalusi csatában a balszárnyát parancsolta, majd 48-ban a lovat (a diktátor másodparancsnoka) visszavitték, hogy rendet tartsanak Olaszországban. Ezt nem tette meg, és valószínűleg 47-ben távolították el állásából; 44-ig nem volt munkahelye, amikor consul lett, mint Cézár kollégája és később papja (flamen)., Consulként és lupercusként, a Lupercalia fesztivál egyik ünnepelõjeként (az év elején termékenységi fesztivál) diademet ajánlott Caesarnak—a jogdíjat jelző szalagot -, amelyet Caesar, a polgárok monarchiával szembeni nyílt ellenszenvének nyomása miatt, nem volt hajlandó elfogadni.
Caesar meggyilkolása után Antonius birtokába került a kincstár és Caesar papírjai, amelyeket saját előnyére használt (és talán kiegészített)., Egy ideig mérsékelt politikát folytatott, de amikor a 19 éves Octavianus (később Augustus császár), Caesar örökbefogadott fia és örököse megtámadta, Caesar gyilkosai ellen fordult. Június 44-én a Szenátus öt évre Észak-és Közép-Gallia, valamint Észak-Olaszország tartományává nyilvánította. Cicero azonban szeptember 44.és április 43. között hevesen megtámadta a Fülöp-szigeteken, Octavianus pedig 43-ban egyesítette erőit a consulokkal. Együttes erejük kétszer legyőzte Antonyt, aki Brutus Albinust ostromolta Mutinában (mai Modena)., Antonynak sikerült visszavonulnia Dél-Galliába. A két consul halála után az ellenfél seregei szétváltak, és Antonius mellé Marcus Aemilius Lepidus és Lucius Munatius Plancus is csatlakozott. November elején Octavianus-jelenleg a konzuli seregek élén-bonóniában (mai Bologna) találkozott Antoniusszal és Lepidusszal. A három ötéves paktumot kötött, amelyet hamarosan egy törvény ratifikált, közös autokráciát, a triumvirátust adva nekik., Több mint 200 embert elítéltek és (amikor elfogták) megöltek (Cicero egyike volt), vagy azért, mert a triumvirok ellenségei voltak, vagy azért, hogy elkobozzák vagyonukat. 42-ben Gaius Cassius és Marcus Brutus két csatában vereséget szenvedett Philippiben (Macedónia), amelyben Antonius megkülönböztette magát parancsnokként, öngyilkos lett, és ezekkel a cselekményekkel a republikánus ügy.
a triumvirok beleegyeztek a birodalom megosztásába, így Antonius folytatta a keleti tartományok adminisztrációját. Először Kleopátra-t, Egyiptom királynőjét hívta Tarsusba (Kis-Ázsia délkeleti részén), hogy válaszoljon arra a jelentésre, hogy segített ellenségeiknek. Sikeresen felmentette magát, Antony pedig 41-40 telét szeretőjeként töltötte az egyiptomi Alexandriában., Az ókori szerzők romantikus beszámolói ellenére azonban nem mozdult arra, hogy több mint három évig újra meglátogassa, bár ebben az időszakban jelentősen megnövelte területi vagyonát.
40 elején Antonius testvére, Lucius Antonius konzul, akit Antonius felesége, Fulvia támogatott, fellázadt Octavianus ellen Olaszországban. Octavianus legyőzte a lázadást, elfoglalta és elpusztította Perusiát (mai Perugia). Antoniusnak vissza kellett térnie Olaszországba, így Ventidius tábornokot bízta meg a kis-ázsiai és Szíriai Parthiai invázióval., Az első összecsapások után Antonius és Octavianus kibékültek Brundisiumban (mai Brindisi), és mivel Fulvia időközben meghalt, Antonius feleségül vette Octavianus húgát, Octaviát. A két férfi megosztotta a birodalmat közöttük, Octavian mindent Scodra-tól nyugatra (mai Shkodër, Alb.) és Antonius mindent Keleten. Lepidus, akit korábban Afrikába zártak, megtarthatta. 39-ben Antonius és Octavianus szerződést kötött Sextus Pompeiusszal (lásd Pompeius Magnus Pius, Sextus), aki uralta a tengereket, és akadályozta Olaszországot.,
Antonius és Octavia Athénba mentek, ahol istenítették őket; Antonius lett az új Dionüszosz, a bor, a boldogság és a halhatatlanság misztikus Istene. Antonius ezután megszervezte a Keletet. Ventidius eközben 40-ben kiszorította a Parthusokat Kis-Ázsiából, és visszavitte őket az Eufrátesz folyón túlra (39-38). Heródes-Róma egyik kiemelkedő Palesztin zsidó barátjának, Antipaternek a fia-Jeruzsálemben, Júdea királyaként jött létre 37-ben. Amikor Octavianusnak 37-ben problémái voltak Olaszországban és nyugaton, Antonius találkozott vele Tarentumban, ellátta hajókkal, és beleegyezett, hogy újabb öt évre megújítja a triumvirátust., Lepidus talán nem szerepel. Octavianus tábornoka, Marcus Vipsanius Agrippa 36-ban legyőzte Sextus Pompeiust. Ezután Lepidus és Octavianus csatolta Afrikát. Octavia, miután 37 óta Rómában volt, Octavianus 35-ben küldte Antonyba. Antonius azért küldte vissza, mert szinte egyetlen katonával sem érkezett meg, akiket Antonius kölcsönadott Octavianusnak. A 36-ban Parthia ellen régóta előkészített támadás kudarcot vallott, súlyos veszteségekkel-ez volt Antonius első katonai kudarca. Ekkor ismét Kleopátra felé fordult, aki két gyermeket szült neki, és teljes politikai és pénzügyi támogatást adott neki.