sisällissota ja triumviraatti
49, vuoden sisällissota puhkesi välillä Pompeius ja Caesar, Antonius oli tribune plebs ja tukenut voimakkaasti Caesar. Hän pakeni Roomasta Caesarin päämajaan saatuaan väkivallan uhan. Antonius taisteli lyhyessä Italian sotaretkellä, joka pakotti Pompeiuksen evakuoimaan Italian niemimaan. Tämän jälkeen Caesar jätti hänet Italian johtoon Espanjan sotaretken ajaksi., Sitten hän liittyi Caesar Kreikassa, käski hänen vasen siipi Taistelussa Pharsalus, ja lähetettiin takaisin kuin mestari hevonen (diktaattori on second-in-command) 48 pitää järjestyksessä, Italia. Hän ei tee tätä, ja oli luultavasti viraltapanon 47; hän oli ilman työtä, kunnes 44, kun hän tuli konsuli kuten kollega ja myöhemmin pappi (flamen) Caesar., Kun konsuli ja lupercus, yksi celebrants festivaali Lupercalia (hedelmällisyyden festivaalin vuoden alussa), hän tarjosi Caesar diadeemi—nauha merkiksi siitä, royalty—joka Caesar, painostavat kansalaisten avointa inhoa monarkia, kieltäytyi hyväksymästä.
Caesarin murhan jälkeen Antonius sai haltuunsa aarrekammion ja Caesarin paperit, joita hän käytti (ja ehkä täydensi) omaksi edukseen., Jonkin aikaa hän harjoitti maltillista politiikkaa, mutta kun 19-vuotias Octavianus (myöhemmin keisari Augustus), Caesarin ottopoika ja perillinen, haastoi hänet, hän kääntyi Caesarin salamurhaajia vastaan. Kesäkuussa 44 senaatti myönsi hänelle Pohjois-ja Keski-Gallian sekä pohjois-Italian läänikseen viideksi vuodeksi. Cicero kuitenkin raivokkaasti hyökkäsi häntä Philippic orations syyskuun 44 ja huhtikuussa 43, ja Octavius yhdistänyt voimansa konsulit 43. Heidän yhdistetyt joukkonsa kukistivat kahdesti Antoniuksen, joka piiritti Brutus Albinusta Mutinassa (nykyinen Modena)., Antonius onnistui vetäytymään eteläiseen Galliaan. Vastustajan armeijat erosivat kuoltua molemmat konsulit, ja Antonius liittyi Marcus Aemilius Lepidus ja Lucius Munatius Plancus sotajoukkoineen. Marraskuun alussa Octavianus—tässä vaiheessa konsuliarmeijoita johtava—tapasi Antoniuksen ja Lepiduksen Bononiassa (nykyinen Bologna). Kolmikko solmi pian lain ratifioiman viisivuotisen sopimuksen, joka antoi heille yhteisen itsevaltiuden, triumviraatin., Yli 200 miehet olivat kiellettyjä ja (jos jää) tappoi (Cicero oli yksi heistä), joko siksi, että he olivat vihollisia triumviriä tai jotta voidaan takavarikoida heidän omaisuutensa. 42 Gaius Cassius ja Marcus Brutus, voitti kaksi taisteluita filippissä (Makedonia), jossa Antonius erottaa itsensä komentaja, tappoi itsensä ja, näiden säädösten, republikaanien syy.
triumviraatin jäsenistä koki päätettiin jakaa empire, joten Antonius eteni vievät hallinto itäisissä maakunnissa. Hän ensin kutsui Cleopatra, Egyptin kuningatar, Tarsus (kaakkois-Aasia Minor) vastata raportoi, että hän oli avustanut niiden vihollisia. Hän onnistui vapauttamaan itsensä, ja Antonius vietti talven 41-40 rakastajanaan Aleksandriassa Egyptissä., Huolimatta romanttinen tilit antiikin kirjailijoiden, kuitenkin, hän ei liiku nähdä hänet jälleen yli kolme vuotta, vaikka hän suuresti lisäsi hänen alueellista omaisuutensa aikana, että väli.
Varhainen 40 Antoniuksen veli, konsuli Lucius Antonius, jota Antoniuksen vaimo Fulvia, kapinoi Octavius Italiassa. Octavianus kukisti kapinan vangiten ja tuhoten Perusian (nykyinen Perugia). Antonius joutui palaamaan Italiaan ja jätti kenraalinsa Ventidioksen hoitamaan parthialaisten hyökkäystä Vähään-Aasiaan ja Syyriaan., Kun ensimmäisen kahakoita, Antonius ja Octavius oli sovittanut klo Brundisium (läsnä-päivä Brindisi) ja koska Fulvia oli kuollut sillä välin, Antonius avioitui Octavianuksen siskon Octavian. Miehet jakoivat valtakunnan keskenään, Octavianus vei kaiken Scodrasta länteen (nykyinen Shkodër, Alb.) ja Antonius kaiken itään. Lepidus, joka oli aiemmin ollut suljettuna Afrikkaan, sai pitää sen. 39 Antonius ja Octavianus tekivät sopimuksen, jossa Sextus Pompeius (ks Pompeius Magnus Pius, Sextus), joka hallitsi meriä ja oli saarrettu, Italia.,
Antonius ja Octavia meni Ateenaan, jossa he olivat palvottuja; Antonius julistettiin Uusi Dionysos, mystic jumala viiniä, onnellisuus ja kuolemattomuus. Antonius organisoi sitten idän. Ventidius puolestaan työnsi parthialaiset pois Vähästä-Aasiasta vuonna 40 ja ajoi heidät takaisin Eufrat-joen (39-38) ulkopuolelle. Herodes—Rooman huomattavan Palestiinalaisjuutalaisen ystävän Antipaterin poika-perustettiin Jerusalemiin Juudean kuninkaaksi vuonna 37. Kun Octavius oli ongelmia, Italiassa ja Länsi-37, Antonius tapasi hänet, Tarentum, toimitetaan hänelle aluksia, ja päätti uudistaa triumviraatti vielä viisi vuotta., Lepidusta ei ehkä otettu mukaan. Vuonna 36 Octavianuksen kenraali Marcus Vipsanius Agrippa kukisti Sextus Pompeiuksen. Tämän jälkeen Lepidus ja Octavianus liittivät Afrikan itseensä. Octavia, joka oli ollut Roomassa vuodesta 37, joutui Octavianuksen Antoniukselle 35. Antonius lähetti hänet takaisin, koska hän saapui lähes mikään joukot Antonius oli lainannut Octavius. Pitkään valmisteltu hyökkäys Parthiaan vuonna 36 epäonnistui raskain tappioin—se oli Antoniuksen ensimmäinen sotilaallinen epäonnistuminen. Tässä vaiheessa hän kääntyi jälleen Kleopatra, joka oli synnyttänyt hänelle kaksi lasta ja antaa hänelle täyden poliittisen ja taloudellisen tukensa.