Vuonna 1996, Borgnine näytteli televisiossa fantasia/jännitys elokuva Merlinin Shop Mystisiä Ihmeitä (osittain muokattu 1984 kauhuelokuva Paholaisen Lahja). Kuten kertojan ja tarinankertoja, Borgnine kertoo merkkijono liittyviä yliluonnollisia tarinoita, hänen nykyajan taruja erityisesti keskitys lumottu ja ilkeä symbaali-hakkaa apina lelu varastettu velho Merlin. Myöhemmin elokuva esitettiin parodisessa televisiosarjassa Mystery Science Theater 3000,ja se on sittemmin saavuttanut merkittävän kulttimaineen., Myös vuonna 1996 Borgnine kiersi Yhdysvalloissa bussissa tapaamassa fanejaan ja katsomassa maata. Matkasta tehtiin vuonna 1997 dokumenttielokuva Ernest Borgnine on the Bus. Hän toimi myös yhden vuoden puheenjohtajana Kansallisen Tervehdys Sairaalaan Veteraanit, vierailevat potilaiden monissa Department of Veterans Affairs medical centers.
Vuonna 1997, Borgnine ilmestyi isossa-näyttö sopeutumista komedia elokuva McHale n Navy, jossa hän pelasi Kontra-Amiraali Quinton McHale, joka oli myös isä Tom Arnold on merkki, Quinton McHale Jr.,
1999-2011: Viime worksEdit
vuodesta 1999, Borgnine edellyttäen, hänen äänensä lahjakkuutta animoitu komediasarja Paavo Pesusieni kuten vanhusten supersankari Merenneito Mies (jos hän oli pariksi hänen McHale n Navy co-tähti Tim Conway ääni Merenneito Miehen apuri Barnacle Boy). Hän ilmaisi kiintymystä tätä roolia kohtaan, eikä pienintäkään osaa sen suosiosta lasten keskuudessa. Kuolemansa jälkeen Nickelodeon esitti uudelleen kaikki jaksot, joissa Merenneitomies esiintyi memoriamissa., Borgnine myös esiintyi itse Simpsons episodi ”Boy-Scoutz ’n the Hood”, lisäksi useita tv-mainoksissa. Tässä 2000, hän oli vastaava tuottaja Hoover, jossa hän oli ainoa hyvitetty näyttelijä.
vuonna 2007 Borgnine näytteli Hallmark original-elokuvassa A Grandpa for Christmas. Hän esitti miestä, joka etääntyneen tyttärensä jouduttua auto-onnettomuuden vuoksi sairaalaan saa selville, että hänellä on lapsenlapsi, josta hän ei koskaan tiennyt. Hänet otetaan miehen huostaan, ja heistä tulee pian suuria ystäviä., Borgnine sai roolisuorituksestaan Golden Globe-ehdokkuuden parhaasta miespääosasta minisarjassa tai elokuvaan, joka tehtiin televisioon. 90-vuotiaana hän oli kaikkien aikojen vanhin Golden Globe-ehdokas.
Borgninen omaelämäkerran Ernie julkaisi Citadel Press heinäkuussa 2008. Ernie on löyhä, keskusteleva muistelu hänen näyttelijänuransa kohokohdista ja merkittävistä tapahtumista hänen yksityiselämästään.
2.huhtikuuta 2009 hän esiintyi pitkään jatkuneen LÄÄKÄRISARJAN ER viimeisessä jaksossa. Hänen roolinsa oli aviomies, jonka pitkä avioliitto päättyi vaimon kuolemaan., Viimeisessä kohtauksessaan hänen roolihahmonsa makaa sairaalasängyssä juuri kuolleen vaimonsa vieressä. Hänen suorituskyky keränneet Emmy-ehdokkuuden Erinomainen Vieras draamasarjassa, hänen kolmas nimitys-ja hänen ensimmäinen 29 vuotta (koska on ehdolla Erinomainen miessivuosa Rajoitettu Sarja tai Erityinen vuonna 1980 Kaikki Hiljainen länsirintamalla).
Vuonna 2009, 92-vuotiaana, hän näytteli Frank, päähenkilö Toinen Harvest Moon, ohjannut Greg Swartz ja myös pääosissa Piper Laurie ja Anne Meara., Lokakuuta 2010 Borgnine esiintyi omana itsenään Morgan Freemanin kanssa Saturday Night Livessä. Lokakuuta 2010 Redissä, joka kuvattiin aiemmin samana vuonna. Loppuvuodesta 2011, Borgnine päätökseen, mikä olisi hänen viimeinen elokuva, pelaa Rex Sivun Mies, Joka kätteli Vicente Fernandez.