Tämä tiili Gothic Revival-tyyliin kirkko ja sen korkea torni korvasi aikaisemman 1872 kirkko vaurioitui pahoin vuoteen 1886 maanjäristys. Vuonna 1891 rakennettu se säilyttää alkuperäisen alttarinsa, ehtoollisraiteensa, penkkinsä ja valaisimensa. Pyhäkkö on yksi harvoista Charlestonin muuttumattomista uskonnollisista sisätiloista, jotka ovat peräisin viktoriaaniselta kaudelta. Nykyään Emanuel on vanhin Afrikkalainen metodistinen episkopaalinen kirkko etelässä ja taloa vanhin Musta seurakunta Baltimoren eteläpuolella, MD.,
tämän seurakunnan historia kuvastaa afroamerikkalaisten uskonnollisten instituutioiden kehitystä Charlestonissa. Sen juuret juontavat vuonna 1791 järjestettyyn uskonnolliseen vapaiden mustien ja orjien ryhmään. Vuonna 1816, musta jäsenten Charleston Methodist Episcopal Church vetäytyi kiistellystä hautaaminen maahan, ja johdolla Morris Brown, muodostettu erillinen seurakunta. Kirkon 1,400 jäsenet pian sen jälkeen asettuneet Afrikkalainen Metodisti Piispanvirka kirkko, kirkkokunta virallisesti perustettu samana vuonna Philadelphia, Pa., Kaksi vuotta myöhemmin Brown ja muut kirkon papit vangittiin valtion ja paikallisten lakien rikkomisesta, joka kielsi valkoisten valvonnasta riippumattomien orjien ja vapaiden mustien uskonnolliset kokoontumiset.