tres términos técnicos comunes en Genética molecular, exón, intrón y codón, tienen definiciones técnicas específicas, pero a menudo se pierden en presentaciones apresuradas o cortas. Lo principal a recordar es que el exón y los intrones son características del ADN, mientras que los codones son características del ARN. Las secuencias homólogas en el otro tipo de nucleicos necesitan ser llamadas otra cosa, de lo contrario existe el peligro de que los roles del ADN y el ARN en el Dogma Central («el ADN hace que el ARN haga proteína») se confundan.,
Por definición, exones e intrones son secuencias en una región génica codificante de proteínas de una molécula de ADN de doble cadena (dsDNA) que se expresan como proteínas, o secuencias intermedias no expresadas así. Los exones e intrones se muestran típicamente como las secuencias monocatenarias de la cadena de sentido del dsDNA, escritas 5 ‘-3′, de izquierda a derecha.la transcripción de la cadena plantilla complementaria produce un ARN nuclear heterogéneo (hnRNA) que es idéntico (co-lineal) en la orientación 5′-3’ y secuencias de base a la cadena de sentido de ADN, con la sustitución de U por T., Las secuencias de ARN equivalentes a los exones e intrones de ADN a veces se conocen como «exones» e «intrones», sin embargo esto es técnicamente incorrecto y también confunde su papel funcional en la transcripción y traducción con exones e intrones como secuencias de genes en el ADN. Las secuencias de ARN equivalentes a exones e intrones de ADN pueden ser referidas como» transcripciones de exones «y» transcripciones de intrones», o» equivalentes», respectivamente.
El procesamiento del hnRNA a ARNm implica la escisión (‘empalme’) de las transcripciones de intrones y la ligadura de los exones restantes., Una vez que se forma el ARNm final, la traducción es el proceso de lectura (como aminoácidos) de una serie de secuencias de tres bases llamadas codones. Los codones se leen de acuerdo con el código genético, que es un código de ARN. Debido a que la región del ARNm es equivalente al exón de ADN, la misma serie se puede identificar en la hebra Sense (sustituyendo T por U). Los motivos de ADN de tres bases son algunos llamados «codones», sin embargo, esto es técnicamente incorrecto y confunde el contenido de información de los Genes con la función del ARN en el código genético. Los equivalentes de ADN a los codones pueden ser referidos como ‘ trillizos.,’
en Bioinformática, los 64 trillizos a veces se presentan como una» tabla de traducción » que se puede usar directamente con la secuencia de hebras de sentido de ADN para inferir la secuencia de proteínas. Esto es práctico, excepto que «Traducción» aquí significa «extracción de información codificada» no es lo mismo que el proceso molecular de traducción de ARNm.
hay una aplicación para esto: ver SM Carr, HT Wareham & Craig D. 2014. Una aplicación web para la generación de ejemplares de secuencias de ADN con marcos de lectura abiertos y cerrados en educación genética y bioinformática., CBE-Life Sciences Education 13, 373-374, que revisa esto e incluye una aplicación que renderiza dsDNA como secuencias de proteínas.