Amerikanske borgerkrig, og efter
Den næste AMERIKANSKE forsøg på submarine warfare kom under borgerkrigen (1861-65), når de Konfødererede Stater tyet til “utraditionelle” metoder til at overvinde Unionens Flåde overlegne styrke, der er udøvet i en blokade af det Sydlige havne. I 1862 Horace L. Hunley af Mobile, Ala., finansieret bygningen af en konfødereret ubåd ved navn Pioneer, et håndværk, der var 34 fod lang og blev drevet af en hånd-forkrøppet propel drives af tre mænd., Det blev sandsynligvis sænket for at forhindre dens fangst, da Unionens styrker besatte ne.Orleans (selv om nogle optegnelser siger, at pioneren var tabt med alle dem ombord under et dykke, mens de var på vej til at angribe Unionens skibe).
den anden ubåd udviklet af de samme bygherrer var et bemærkelsesværdigt avanceret koncept: en 25-fods jernbåd beregnet til at blive drevet af et batteri og elmotorer. Ikke overraskende kunne der ikke findes nogen egnede motorer, så en propel, der blev forkrøppet af fire mænd, blev igen vedtaget. Ubåden sank uden tab af liv i tunge Hav ud for Mobile Bay, mens de forsøgte at angribe fjenden.,
den tredje ubåd i Confederacy var H. L. Hunley, en modificeret jernkedel forlænget til mellem 36 og 40 fod. Ballasttanke og et system af vægte nedsænket fartøjet; det kunne rejse med en hastighed på fire miles i timen, drevet af otte mænd, der drejer propellen. Dens bevæbning bestod af en” torpedo”, fyldt med 90 pund (40 kg) krybdyr, trukket bag ubåden i slutningen af en 200 fods linje. Hunley skulle dykke under et fjendtligt krigsskib og trække torpedoen mod skroget., Efter en vellykket test mod en pram, Hunley blev flyttet af jernbanen til Charleston, SC der skibet lidt flere katastrofer, synker tre gange og drukne en række besætningsmedlemmer herunder Hunley selv. Bemandet for fjerde gang var Hunley udstyret med en “torpedo” på enden af en lang spar, og håndværket lavede flere succesfulde dyk. Om natten af februar. 17, 1864 angreb ubåden Unionens krigsskib Housatonic i Charleston harbour., Torpedoens detonation eksploderede krigsskibets magasiner: Housatonic sank i lavt vand med tabet af fem mænd, men Hunley blev også ødelagt af eksplosionen, og dets besætning blev dræbt.
En af de mere frygtløse ubåd opfindere af den samme periode var Wilhelm Bauer, en noncommissioned officer af Bayerske artilleri, der blev bygget to både, Le Plongeur-Marin (1851) og Le Diable-Marin (1855). Den første båd synkede i Kiel havn den Feb. 1, 1851, men Bauer og hans to assistenter undslap fra en dybde af 60 fod efter fartøjet havde været på bunden i fem timer., Hans andet håndværk, bygget til den russiske regering, var vellykket og efter sigende gjort 134 dyk før de går tabt på havet. I September 1856, under kroningen af Kejser Alexander II, Bauer nedsænket sin ubåd i Kronshtadt havn med flere musikere om bord. En undervandsgengivelse af den russiske nationalsang blev tydeligt hørt af personer inde i skibe i havnen.