under hans magtovertagelse viste Toussaint kloge politiske færdigheder såvel som stor militær evne. I 1794 var det generalguvernøren for Saint-Domingue, Etienne Laveau., der gjorde Toussaint til viceguvernør for kolonien, men i 1796 havde Toussaint lettet Laveau. og var selv blevet guvernør-general. Britiske styrker havde også en tilstedeværelse på Hispaniola, men militære tab skubbede dem ind i forhandlinger med Toussaint. Traktater indgået i 1798 og 1799 sikrede deres fuldstændige tilbagetrækning fra øen., Toussaint forblev forpligtet til at befri alle på øen, der stadig var slaver. Indtil 1801 slaveriet varede i spansk Santo Domingo. Ignorerer kommandoer til det modsatte af Napoleon Bonaparte, der var blevet Første konsul i Frankrig, Toussaint overran Santo Domingo og befriede sine slaver, engang i kommando af hele øen, Toussaint dikterede en forfatning, der gjorde ham til guvernør-general for livet med næsten absolutte magter. Ud over at sanktionere mange revolutionære principper, Toussaint forfatning udråbt hans succes med at genoprette orden og velstand til øen., Toussaint var faktisk ansvarlig for at skabe en række økonomiske fremskridt. Plantager ødelagt under slaveoprøret blev gendannet, og Toussaint opfordrede endda mange af de franske indehavere til at vende tilbage. Selvom Toussaint brugte militær disciplin til at tvinge tidligere slaver på øen til at arbejde, de var lovligt frie og lige, og arbejdere delte overskuddet i de restaurerede plantager. Under Toussaint ledelse lukrativ handel blev påbegyndt med Storbritannien og med USA., Til gengæld for våben og varer solgte Toussaint sukker og lovede ikke at invadere Jamaica eller det amerikanske syd.