RNA-Polymerase Typer og Roller i Eukaryoter

RNA-polymerase (RNAP) er det enzym, der er ansvarlig for transskription i eukaryote celler. I modsætning til bakterieceller, hvor en enkelt RNAP Letter transkription, er der tre typer RNAP i eukaryoter, der spiller forskellige roller i genekspression.

Billedkredit: Ktsdesign /

RNA-Polymerasestruktur

underenheder

alle tre RNAPs har katalytiske kerner bestående af 10 underenheder., Fem af disse er centrale underenheder, der danner krabbekloformer med DNA i deres centre, kanaler for RNA-produkter og NTP-substrater samt yderligere 5 enheder.

den klølignende form stabiliserer DNA ‘ et og muliggør korrekt dannelse af transkriptionsbobler (områder, hvor DNA-strenge er afviklet nær gener, der skal transkriberes.) RNAP II består kun af 12 underenheder i alt. Sammen med de 10 katalytiske underenheder, der findes i alle RNAPs, har RNAP II to Rpb4⧸7, hvilken initieringstranskription.,

RNAP II er det en .ym, der primært er ansvarlig for syntesen af messenger RNA (mRNA). RNAP I og III indeholder en ekstra heterodimerisk underenhed. RNAP III alene har en heterotrimerisk underenhed, hvilket giver i alt 17 underenheder.

Repeat sekvenser

RNAP II har flere gentag enheder, der ligger på etage ende (Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser), som ikke findes i enten RNAP i eller III. Disse gentagelser giver proteiner til at binde til RNAP II molekyle og indlede sin aktivitet.,

funktionel betydning af underenheder

de yderligere underenheder, der findes i RNAP III, antages at give en .ymet øget fleksibilitet sammenlignet med andre RNAPs. Mens RNAP I (placeret i kernen) alene er ansvarlig for syntesen af det store ribosomale RNA (rRNA) underenhed.

den meget rigelige RNAP III, kendt for sin stabilitet, syntetiserer store mængder tRNA, 5S rRNA og andre produkter til proteinsyntese. Begge polymeraser spiller strukturelle og katalytiske roller i cellen.,

Rnap II ‘ s rolle i transkription

Binding til promotor

uanset art spiller RNAP en rolle i transkription. Ved binding til promotorstedet på en DNA-streng danner RNAP sammen med transkriptionsfaktorer et transkription pre-initiation comple. (PIC). Dette indleder processen med transkription.

promotorstedet er et område placeret opstrøms ved 5′ – enden af en DNA-streng. En at-rich Tata-boks er den mest velkendte promotorsekvens og bruges af RNAP II. Denne promotor findes dog kun hos cirka 10-15% af pattedyrsarterne.,

transkriptionsfaktorer som TFIID binder til Tata-boksen, hvilket forårsager en dramatisk ændring i formen af DNA-stativet. Dette gør det muligt for andre proteiner at samle på promotorstedet med RNAP II, der danner transkription initiation comple. (TIC).

tilsætning af fosfatgrupper

fosfatgrupper tilsættes til haleenden af RNAP II ved TFIIH, hvilket frigiver en .ymet, så det kan starte transkriptionsprocessen. Transkriptionsfaktorerne på promotorstedet frigives og genanvendes derefter, så de kan begynde en ny runde af transkription., Phosphatase fjerner fosfatgrupperne fra RNAP II, når transkriptionsprocessen er afsluttet.

5′ Cap

RNA er begrænset ved 5′ – enden. Denne hætte består af guanin og en methylgruppe. RNA-polyadenylering forekommer i 3 ‘ – enden, hvor adenosinmonophosphat-gentagelserne sættes til RNA-molekylet, hvilket resulterer i dannelse af en poly A-hale. Dette hjælper en jævn overførsel af mRNA fra kernen, øger det levetid i celle cytoplasma, og forbedrer dens translationelle effektivitet.,

transkription faciliteret af RNA-Polymerase i og III

promotorsekvensen forbundet med syntesen af rRNA er 150 basepar i længden. To transskriptionsfaktorer, UBF og SL1 binder til promotoren og rekrutterer RNAP I til siteebstedet.

de promotorsekvenser, der anvendes af RNAP III, adskiller sig fra dem, der anvendes af andre polymeraser, da de er interne promotorer snarere end på et opstrøms sted. Transkriptionsfaktoren TFIIIC binder til promotoren placeret inden i DNA-strengen og rekrutterer TFIIIB opstrøms for transkriptionsstartstedet.,

de efterfølgende hændelser er ikke velkarakteriserede, selv om det er blevet antydet, at RNAP III langsomt adskiller sig fra sine transkriptionsfaktorer, hvilket resulterer i en langsom clearance fra initieringsstedet.

yderligere læsning

• alt RNA-indhold
• hvad er RNA?
• RNA Struktur
• Typer af RNA: mRNA, rRNA og tRNA
• RNA-Syntese

citater