fylogeni, historien om udviklingen af en art eller gruppe, især med henvisning til afstamningslinjer og forhold mellem brede grupper af organismer.
grundlæggende for fylogeni er forslaget, universelt accepteret i det videnskabelige samfund, at planter eller dyr af forskellige arter stammer fra fælles forfædre. Beviserne for sådanne forhold er imidlertid næsten altid ufuldstændige, for langt de fleste arter, der nogensinde har levet, er uddøde, og relativt få af deres rester er bevaret i fossilregistret. De fleste fylogenier er derfor hypoteser og er baseret på indirekte bevis. Forskellige fylogenier opstår ofte ved hjælp af de samme beviser., Ikke desto mindre er der universel enighed om, at livets træ er resultatet af organisk afstamning fra tidligere forfædre, og at ægte fylogenier kan opdages, i det mindste i princippet.